More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2473 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2473  peptidase M20  100 
 
 
356 aa  698    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0327  Acetylornithine deacetylase/Succinyl- diaminopimelate desuccinylase and related deacylase-like protein  61.94 
 
 
434 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  33.8 
 
 
362 aa  186  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  34.25 
 
 
369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  34.2 
 
 
364 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  34.89 
 
 
378 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0672  peptidase M20  34.68 
 
 
366 aa  149  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  31.78 
 
 
365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1186  M20/M25/M40 family peptidase  31.4 
 
 
363 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390537  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1019  peptidase dimerisation domain protein  33.86 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  34.45 
 
 
400 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.09 
 
 
413 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.2 
 
 
433 aa  100  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  29.89 
 
 
419 aa  92.8  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.87 
 
 
388 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.5 
 
 
399 aa  87  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.36 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  35.71 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.94 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  34.3 
 
 
420 aa  84  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.46 
 
 
399 aa  82.8  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05749  putative acetylornithine deacetylase (Eurofung)  31.43 
 
 
424 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0187608 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.7 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.21 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  29.25 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0170  acetyl-lysine deacetylase  26.32 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000443828  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  30.39 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.63 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.63 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.63 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.63 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  31.67 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  29.02 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  30.15 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.8 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  29.24 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.17 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.88 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1351  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.03 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  37.13 
 
 
376 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  28.31 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29 
 
 
385 aa  72  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  35.24 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  30.43 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.27 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.22 
 
 
370 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.46 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.52 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  32.41 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  25.21 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.89 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  27.49 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  29.34 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2044  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.75 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1541  peptidase M20  28.52 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  22.65 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  34.72 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  25.65 
 
 
379 aa  69.3  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4337  peptidase M20  28.07 
 
 
379 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  29.05 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  26.76 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  26.49 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  28.22 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.82 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  27.87 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0829  peptidase M20  30.07 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0413272  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0277  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.97 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.67 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  27.03 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.25 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  27.03 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2842  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.77 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  29.68 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  25.88 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5029  acetylornithine deacetylase  36.14 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0867  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  30.11 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.19 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1085  peptidase M20  25.62 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000939958 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  28.9 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 
385 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  26.7 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  30.99 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  39.13 
 
 
389 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31.21 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  28.03 
 
 
385 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.72 
 
 
375 aa  67  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.18 
 
 
369 aa  67  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  30.75 
 
 
387 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  27.85 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0990  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.56 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.87 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  25.07 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  27.99 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3178  peptidase M20  25.71 
 
 
403 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  31.9 
 
 
390 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.97 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.67 
 
 
353 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  28.7 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  25.78 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  26.76 
 
 
416 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>