More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5033 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  100 
 
 		 376 aa  743    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  84.35 
 
 		 377 aa  628  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  50.41 
 
 		 376 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  44.88 
 
 		 376 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  43.27 
 
 		 376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  44.33 
 
 		 376 aa  269  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  45.91 
 
 		 376 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  43.27 
 
 		 376 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  43.01 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  46.93 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  45.36 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  43.09 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  40.16 
 
 		 372 aa  219  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  39.5 
 
 		 376 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  40.9 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  41.74 
 
 		 372 aa  212  9e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  41.73 
 
 		 378 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  38.38 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  37.23 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  37.23 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  38.78 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  38.31 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  38.48 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  44.84 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  34.78 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  39.06 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  35.75 
 
 		 385 aa  186  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  37.91 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.83 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  37.47 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  34.16 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  38.02 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  37.19 
 
 		 382 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  34.96 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  38.18 
 
 		 381 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  33.06 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  37.87 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  43.55 
 
 		 391 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  40.5 
 
 		 376 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  35.45 
 
 		 409 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  33.33 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  36.88 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  40.91 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  36.27 
 
 		 387 aa  162  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  31.91 
 
 		 413 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  31.93 
 
 		 413 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.96 
 
 		 363 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  34.77 
 
 		 407 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  35.09 
 
 		 407 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  30.47 
 
 		 417 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  38.54 
 
 		 412 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  30.75 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  32.27 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  30.46 
 
 		 410 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  36.07 
 
 		 389 aa  149  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  29.76 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  35.1 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  30.71 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  30.71 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  30.71 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  30.26 
 
 		 428 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.68 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  29.97 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  30.59 
 
 		 438 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.68 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  32.05 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  28.26 
 
 		 422 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  35.13 
 
 		 401 aa  133  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  29.11 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  33.22 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  30.97 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  31.53 
 
 		 436 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  31.13 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  34.18 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  32.74 
 
 		 402 aa  122  7e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  28.18 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  29.22 
 
 		 403 aa  93.2  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.05 
 
 		 402 aa  92.8  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  28.84 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  31.54 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.78 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  32.52 
 
 		 383 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  32.45 
 
 		 416 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  36.93 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1579  acetylornithine deacetylase  30.19 
 
 		 387 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.669783 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  31.95 
 
 		 412 aa  86.3  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  37.89 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  37.89 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  37.89 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  37.89 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  37.89 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  37.89 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  37.89 
 
 		 586 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  30.48 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.45 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  36.32 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0237  acetylornithine deacetylase  33.6 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.33 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.05 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  26.29 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>