More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0492 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  100 
 
 
376 aa  768    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  41.24 
 
 
372 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  40.93 
 
 
378 aa  256  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  40.97 
 
 
372 aa  255  7e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  40.85 
 
 
388 aa  249  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  41.3 
 
 
376 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  39.63 
 
 
381 aa  232  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  36.87 
 
 
388 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  36.87 
 
 
388 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  40.99 
 
 
391 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  39.62 
 
 
367 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  36.8 
 
 
391 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  37.94 
 
 
376 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  36.16 
 
 
376 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  36.59 
 
 
376 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  36.86 
 
 
376 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  39.5 
 
 
376 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  39.08 
 
 
376 aa  216  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  42.95 
 
 
420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  36.31 
 
 
376 aa  213  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  37.04 
 
 
385 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  38.63 
 
 
377 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  34.95 
 
 
405 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  37.77 
 
 
375 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  37.3 
 
 
412 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  32.09 
 
 
385 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  35.89 
 
 
376 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  33.69 
 
 
408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  33.77 
 
 
385 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  33.51 
 
 
413 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  33.52 
 
 
413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  34.94 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  31.22 
 
 
374 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  31.84 
 
 
374 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  33.06 
 
 
383 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  31.23 
 
 
409 aa  179  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  34.68 
 
 
376 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  32.9 
 
 
428 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  32.96 
 
 
383 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  32.46 
 
 
436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  31.83 
 
 
436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  30 
 
 
394 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  31.58 
 
 
429 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  31.44 
 
 
394 aa  170  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  33.05 
 
 
382 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  32.38 
 
 
383 aa  169  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  32.12 
 
 
436 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  32.59 
 
 
409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  33.33 
 
 
382 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  34.95 
 
 
387 aa  166  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  33.33 
 
 
382 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  30.63 
 
 
432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  30.97 
 
 
438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  32.77 
 
 
382 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  31.55 
 
 
409 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  31.84 
 
 
412 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.24 
 
 
405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  28.91 
 
 
410 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  30.38 
 
 
407 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  33.33 
 
 
389 aa  150  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  29.32 
 
 
415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  29.59 
 
 
407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.05 
 
 
363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  29.63 
 
 
422 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  29.87 
 
 
418 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.65 
 
 
358 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.65 
 
 
358 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  31.55 
 
 
402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  28.64 
 
 
417 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  30.36 
 
 
424 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  33.07 
 
 
401 aa  133  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  29.24 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  29.6 
 
 
416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  33.55 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  29.71 
 
 
402 aa  123  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  28.65 
 
 
424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  31.13 
 
 
418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  27.25 
 
 
432 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  29.14 
 
 
365 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  24.27 
 
 
743 aa  101  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  27.3 
 
 
434 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  27.79 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  27.68 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  26.77 
 
 
368 aa  92.8  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  27.1 
 
 
372 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  26.19 
 
 
377 aa  89.7  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  27.97 
 
 
441 aa  89.4  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  28.71 
 
 
368 aa  88.2  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  27.47 
 
 
368 aa  86.3  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  29.17 
 
 
360 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  24.14 
 
 
374 aa  86.3  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.74 
 
 
388 aa  85.9  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  25.72 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  27.04 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  24.34 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  25.13 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0276  peptidase M20  28.85 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  27.22 
 
 
368 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  24.74 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  26.93 
 
 
375 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>