190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5703 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  100 
 
 
405 aa  778    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  80.25 
 
 
412 aa  587  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  51.69 
 
 
375 aa  333  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  52.17 
 
 
391 aa  326  5e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  47.82 
 
 
376 aa  276  5e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  43.07 
 
 
388 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  41.36 
 
 
378 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  39.66 
 
 
372 aa  230  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  38.35 
 
 
372 aa  222  9e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  35.59 
 
 
376 aa  219  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  39.36 
 
 
381 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  41.9 
 
 
367 aa  205  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  35.65 
 
 
391 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  35.23 
 
 
376 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  33.58 
 
 
385 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  37.59 
 
 
385 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  39.16 
 
 
420 aa  166  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  35.36 
 
 
388 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  35.36 
 
 
388 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  33.01 
 
 
394 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  32.6 
 
 
409 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  35.1 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  34.92 
 
 
377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  33.92 
 
 
388 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  31.33 
 
 
413 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  31.05 
 
 
413 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  33.41 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  31.12 
 
 
374 aa  144  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  32.76 
 
 
408 aa  143  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  31.72 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  31.52 
 
 
374 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  33.91 
 
 
383 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  29.78 
 
 
376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  30.84 
 
 
376 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  34.4 
 
 
385 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  31.12 
 
 
376 aa  133  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  35.45 
 
 
382 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  29.78 
 
 
376 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  34.46 
 
 
409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  30.29 
 
 
376 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  31.4 
 
 
376 aa  130  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.53 
 
 
405 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  35.18 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  30.02 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.23 
 
 
394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  26.57 
 
 
372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  31.81 
 
 
409 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  34.64 
 
 
382 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  32.11 
 
 
410 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.7 
 
 
358 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.7 
 
 
358 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  34.07 
 
 
401 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  32.84 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  34.47 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.94 
 
 
363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  31.4 
 
 
407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  34.47 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  28.57 
 
 
438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  30.23 
 
 
407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  29.08 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  30.79 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  31.27 
 
 
412 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  27.84 
 
 
436 aa  113  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  27.19 
 
 
428 aa  113  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  29.75 
 
 
415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  27.87 
 
 
436 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  29.91 
 
 
423 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  26.93 
 
 
436 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  30.49 
 
 
418 aa  99.4  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  28.5 
 
 
424 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  26.67 
 
 
416 aa  93.2  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  28.47 
 
 
424 aa  93.2  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  42.18 
 
 
402 aa  92.8  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  26.97 
 
 
417 aa  90.5  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  27.68 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  27.3 
 
 
434 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  27.7 
 
 
422 aa  80.1  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.64 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  28.57 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  28.36 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  42.86 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  26.36 
 
 
432 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  26.23 
 
 
404 aa  63.5  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  28.89 
 
 
397 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  28.96 
 
 
434 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  24.11 
 
 
469 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  27.05 
 
 
428 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  25.72 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.74 
 
 
389 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0219  peptidase dimerization domain protein  38.89 
 
 
384 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176401  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7333  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.75 
 
 
384 aa  56.6  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.35 
 
 
389 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  34.83 
 
 
453 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  34.83 
 
 
453 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  34.83 
 
 
453 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  33.86 
 
 
464 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  28.85 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.99 
 
 
387 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1633  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.69 
 
 
403 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.73321  normal  0.191724 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  26.94 
 
 
397 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>