More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0366 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  100 
 
 
367 aa  721    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  46.32 
 
 
378 aa  279  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  43.43 
 
 
388 aa  269  7e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  43.21 
 
 
372 aa  255  7e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  41.42 
 
 
376 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  42.19 
 
 
372 aa  242  7.999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  41.87 
 
 
388 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  39.62 
 
 
376 aa  238  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  41.87 
 
 
388 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  43.4 
 
 
375 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  39.67 
 
 
391 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  47.56 
 
 
381 aa  232  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  43.78 
 
 
376 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  44.72 
 
 
385 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  46.15 
 
 
412 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  43.21 
 
 
377 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  46.43 
 
 
376 aa  215  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  44.84 
 
 
391 aa  208  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  47.04 
 
 
420 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  37.75 
 
 
374 aa  203  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  37.09 
 
 
374 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  41.75 
 
 
405 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  36.27 
 
 
376 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  36.53 
 
 
376 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  37.96 
 
 
376 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  38.26 
 
 
376 aa  190  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  36.91 
 
 
376 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  39.95 
 
 
376 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  40.6 
 
 
388 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  40.05 
 
 
376 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  39.12 
 
 
383 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  38.62 
 
 
408 aa  169  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  34.62 
 
 
410 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  34.84 
 
 
432 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  38.7 
 
 
383 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.6 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  32.8 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  35.87 
 
 
415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  32.02 
 
 
436 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  32.53 
 
 
416 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  32.79 
 
 
413 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  32.53 
 
 
409 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  33.6 
 
 
385 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  33.52 
 
 
394 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  33.61 
 
 
413 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  38.28 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  29.32 
 
 
436 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  36.64 
 
 
394 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  28.8 
 
 
436 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  30.57 
 
 
429 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  35.97 
 
 
405 aa  149  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  31.04 
 
 
409 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  37.09 
 
 
382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  36.41 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  36.26 
 
 
382 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  36.81 
 
 
382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  29.5 
 
 
428 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  37.36 
 
 
382 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  33.22 
 
 
407 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  33.55 
 
 
407 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  29.92 
 
 
438 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  29.44 
 
 
417 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  38.54 
 
 
385 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  30.56 
 
 
418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  31.75 
 
 
424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  28.57 
 
 
372 aa  136  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.24 
 
 
358 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.24 
 
 
358 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  36.25 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  29.71 
 
 
422 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  32.05 
 
 
423 aa  118  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  34.76 
 
 
389 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  33.24 
 
 
401 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  33.33 
 
 
418 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  35.62 
 
 
402 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  26.89 
 
 
432 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  29.68 
 
 
402 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  32.56 
 
 
399 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  25.94 
 
 
365 aa  90.1  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1291  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.27 
 
 
378 aa  89  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.42 
 
 
391 aa  87.8  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.53 
 
 
391 aa  87  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  26.65 
 
 
370 aa  86.3  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  30.09 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  28.03 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  32.65 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  32.82 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  29.78 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  29.78 
 
 
386 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  28.61 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  32.13 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  31.83 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  27.86 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  29.13 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  26.1 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  29.47 
 
 
391 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  27.16 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  32.26 
 
 
387 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.81 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.16 
 
 
392 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>