More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0060 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  100 
 
 		 429 aa  868    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  63.19 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  59.95 
 
 		 428 aa  511  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  64.82 
 
 		 436 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  64.87 
 
 		 438 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  61.9 
 
 		 436 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  43.94 
 
 		 424 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  41.67 
 
 		 418 aa  295  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  43.29 
 
 		 417 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  42.07 
 
 		 412 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  42.97 
 
 		 422 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  43.15 
 
 		 416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  42.16 
 
 		 409 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  40.61 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  39.76 
 
 		 410 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  41.52 
 
 		 432 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  37.78 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  35.15 
 
 		 413 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  34.12 
 
 		 409 aa  229  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  34.68 
 
 		 413 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  31.58 
 
 		 376 aa  172  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  31.54 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  31.35 
 
 		 372 aa  166  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  31.68 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  31.31 
 
 		 378 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  31.2 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  31.52 
 
 		 391 aa  153  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30.77 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  30.08 
 
 		 376 aa  146  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  27.63 
 
 		 374 aa  143  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  27.63 
 
 		 374 aa  143  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  29.79 
 
 		 367 aa  139  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  31.59 
 
 		 375 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  31.05 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  30.25 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  29.86 
 
 		 383 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.05 
 
 		 376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  31.05 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  31.05 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  29.5 
 
 		 381 aa  133  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.19 
 
 		 358 aa  130  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.19 
 
 		 358 aa  130  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  29.79 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  28.5 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  30.1 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.15 
 
 		 394 aa  126  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  31.06 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  30.26 
 
 		 382 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  30.26 
 
 		 382 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  28 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  27.85 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  30.92 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  30.05 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  28.69 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.78 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  27.65 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  29.35 
 
 		 388 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  30.07 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  30.52 
 
 		 389 aa  113  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  26.93 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  28.61 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  26.89 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  26.61 
 
 		 385 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  27.56 
 
 		 405 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  26.26 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  27.81 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  25.83 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  26.01 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  30.67 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  24.41 
 
 		 372 aa  99.4  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  24.6 
 
 		 363 aa  93.6  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  25.7 
 
 		 402 aa  92.8  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  27.83 
 
 		 424 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  24.16 
 
 		 432 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  26.91 
 
 		 436 aa  89  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  26.92 
 
 		 401 aa  86.7  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  26.21 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  25.71 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  25.67 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  24.43 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  27.92 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  28.13 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  25.99 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  27.01 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  28.73 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  24.75 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  26.97 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  25 
 
 		 441 aa  67  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  23.14 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  27.88 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  27.39 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  25.66 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  23.97 
 
 		 368 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  22.11 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  24.38 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  23.65 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.64 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.45 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.06 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  24.04 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>