297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0873 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  86.17 
 
 		 376 aa  646    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  100 
 
 		 376 aa  743    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  71.73 
 
 		 376 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  71.73 
 
 		 376 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  70.67 
 
 		 376 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  70.4 
 
 		 376 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  68.8 
 
 		 376 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  75.27 
 
 		 388 aa  518  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  46.45 
 
 		 376 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  42.47 
 
 		 376 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  45.65 
 
 		 377 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  37.23 
 
 		 388 aa  209  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  34.68 
 
 		 376 aa  186  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  38.42 
 
 		 378 aa  186  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  40.05 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  36.22 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  31.82 
 
 		 374 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  32.71 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  34.76 
 
 		 383 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  34.59 
 
 		 372 aa  173  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  35.86 
 
 		 408 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  34.22 
 
 		 383 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  32.61 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  34.92 
 
 		 409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  33.06 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  37 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  33.79 
 
 		 388 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  33.79 
 
 		 388 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  35.75 
 
 		 385 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  36.17 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  37.37 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  35.51 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  36.86 
 
 		 391 aa  146  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  29.11 
 
 		 413 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  34.4 
 
 		 389 aa  143  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  29.08 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  34.31 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  32 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  32 
 
 		 407 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  34.69 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  34.38 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.56 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  37.05 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  29.29 
 
 		 372 aa  136  7.000000000000001e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  29.46 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  29.35 
 
 		 394 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  28.73 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  37.67 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  29.44 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  36.07 
 
 		 382 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  35.74 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  32.53 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  29.22 
 
 		 409 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  27.73 
 
 		 432 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.8 
 
 		 405 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  29.02 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  32.14 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.1 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  28.42 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  27.73 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  27.84 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.25 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.25 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  32.91 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  28.07 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  32.81 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  35.11 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  27.78 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  28 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  27.11 
 
 		 436 aa  103  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  28.57 
 
 		 428 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  27.86 
 
 		 418 aa  96.3  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  25.26 
 
 		 436 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  25.53 
 
 		 436 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  30.67 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  23.77 
 
 		 743 aa  91.3  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  27.39 
 
 		 438 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  28.35 
 
 		 432 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  28.05 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  28.53 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  28.46 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  30.29 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  27.38 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2393  peptidase dimerisation domain protein  29.07 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000137501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  27.5 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  27.51 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  28 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  31.25 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  26.63 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12180  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  28.74 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0246803  normal  0.255441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0411  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.17 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1080  acetylornithine deacetylase  27.87 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2938  acetylornithine deacetylase  26.19 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  20.66 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  31.51 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  25.66 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  27.85 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  28.39 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  26.61 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1610  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 447 aa  59.7  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>