More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5339 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  100 
 
 		 377 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  84.35 
 
 		 376 aa  628  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  51.52 
 
 		 376 aa  328  8e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  44.9 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  47.03 
 
 		 376 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  45.15 
 
 		 376 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  43.21 
 
 		 376 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  42.94 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  42.66 
 
 		 376 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  46.35 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  44.85 
 
 		 376 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  38.86 
 
 		 388 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  38.63 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  39.11 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  42.48 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  42.51 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  42.5 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  39.47 
 
 		 385 aa  202  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  36.31 
 
 		 388 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  36.31 
 
 		 388 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  38.19 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  45.3 
 
 		 420 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  39.61 
 
 		 383 aa  189  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  37.15 
 
 		 385 aa  185  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  38.76 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  34.69 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  39.67 
 
 		 383 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  35.26 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  37.14 
 
 		 382 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  39.46 
 
 		 381 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  34.45 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  36.87 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  38.12 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  36.87 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  40.17 
 
 		 391 aa  176  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  38.56 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  39.34 
 
 		 376 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.24 
 
 		 405 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  36.22 
 
 		 409 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  32.43 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  35.12 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.64 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  36.81 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  39.43 
 
 		 412 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  34.75 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  34.8 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  34.8 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  30.81 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  40.26 
 
 		 385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  33.66 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  30.08 
 
 		 413 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  31.61 
 
 		 416 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  34.92 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  29.46 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  30.18 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  32.9 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  28.16 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  34.7 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  33.55 
 
 		 423 aa  130  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  32.57 
 
 		 436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  32.14 
 
 		 410 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  29.79 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  30.5 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.95 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  30.08 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.95 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  36.45 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  30.62 
 
 		 409 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  30.62 
 
 		 412 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  28.69 
 
 		 422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  28.23 
 
 		 436 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  28.79 
 
 		 418 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  29.97 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  31.39 
 
 		 432 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  30.94 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  31.49 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  29.89 
 
 		 383 aa  96.7  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1579  acetylornithine deacetylase  31.54 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.669783 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  30.3 
 
 		 403 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  30.86 
 
 		 379 aa  90.9  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0237  acetylornithine deacetylase  30.73 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  27.34 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  37.57 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  32.95 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.06 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.2 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.2 
 
 		 392 aa  87.4  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.66 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1880  acetylornithine deacetylase  30.73 
 
 		 387 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.26 
 
 		 389 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.91 
 
 		 397 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  28.34 
 
 		 365 aa  86.3  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  37.37 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.62 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  37.37 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  37.37 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  37.37 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  37.38 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  37.38 
 
 		 586 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  37.38 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>