More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1198 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  86.7 
 
 		 376 aa  678    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  82.67 
 
 		 376 aa  646    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  85.07 
 
 		 376 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  100 
 
 		 376 aa  768    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  85.37 
 
 		 376 aa  666    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  69.6 
 
 		 376 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  68.8 
 
 		 376 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  65.55 
 
 		 388 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  46.4 
 
 		 376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  44.88 
 
 		 376 aa  285  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  44.9 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  36.16 
 
 		 376 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  37.87 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  37.23 
 
 		 378 aa  199  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  34.74 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  35.25 
 
 		 372 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  36.53 
 
 		 367 aa  186  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  34.96 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  34.14 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  35.79 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  33.51 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  32.97 
 
 		 388 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  32.97 
 
 		 388 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  34.05 
 
 		 383 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  32.19 
 
 		 374 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  31.3 
 
 		 374 aa  169  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  30.89 
 
 		 385 aa  166  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  36.91 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  30.67 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  31.12 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  30.26 
 
 		 410 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  34.45 
 
 		 420 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  35.04 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  30.62 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  37.37 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  30 
 
 		 409 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  33.33 
 
 		 409 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  29.6 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  33.86 
 
 		 412 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  28.88 
 
 		 391 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.44 
 
 		 394 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  32.61 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.06 
 
 		 376 aa  139  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  32.9 
 
 		 387 aa  139  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  32.35 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  28.65 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  30.29 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.25 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  29.68 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  33.15 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  34.55 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  29.68 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  29.44 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  29.97 
 
 		 407 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  28.81 
 
 		 407 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  28.88 
 
 		 432 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  28.91 
 
 		 415 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  34.88 
 
 		 382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  34.88 
 
 		 382 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.65 
 
 		 363 aa  126  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  28.76 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  28 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  29.85 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  29.43 
 
 		 416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.9 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.9 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  27.11 
 
 		 438 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  28.33 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  27.88 
 
 		 428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  30.62 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  24.74 
 
 		 436 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  24.42 
 
 		 436 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  24.21 
 
 		 436 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  32.01 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  27.48 
 
 		 402 aa  99.4  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  28.43 
 
 		 402 aa  90.5  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  27.92 
 
 		 424 aa  79.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  25.95 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  26.56 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  28.87 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  27.03 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  27.16 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  27.73 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  28.57 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  27.91 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  24.93 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  22.4 
 
 		 743 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  27.1 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  25.13 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  30.06 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  24.05 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  23.62 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  23.21 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  20.4 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  24.85 
 
 		 370 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  27.8 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.79 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  26.41 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  24.67 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  27.53 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>