More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1605 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  100 
 
 
368 aa  730    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  55.56 
 
 
375 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  48.5 
 
 
372 aa  340  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  48.5 
 
 
372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4216  peptidase T  48.5 
 
 
372 aa  338  7e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00206895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  48.5 
 
 
372 aa  338  7e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  48.23 
 
 
372 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  48.23 
 
 
372 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  48.23 
 
 
372 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  48.23 
 
 
372 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  49.86 
 
 
374 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  48.23 
 
 
372 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  48.23 
 
 
372 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  48.23 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  49.59 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  49.86 
 
 
377 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  45.63 
 
 
370 aa  323  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  53.01 
 
 
372 aa  323  4e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  48.5 
 
 
375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3034  peptidase T-like protein  49.45 
 
 
374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  42.51 
 
 
368 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  43.75 
 
 
377 aa  308  9e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  43.6 
 
 
372 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  41.89 
 
 
365 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  45.03 
 
 
381 aa  294  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  46.03 
 
 
376 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  42.62 
 
 
368 aa  291  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  41.89 
 
 
374 aa  290  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  45.18 
 
 
368 aa  288  7e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  44.32 
 
 
368 aa  288  9e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  43.51 
 
 
377 aa  287  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  43.51 
 
 
377 aa  287  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  42.9 
 
 
391 aa  287  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  43.87 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  42.62 
 
 
368 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  43.58 
 
 
379 aa  280  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  42.05 
 
 
389 aa  276  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  42.58 
 
 
368 aa  275  9e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  42.55 
 
 
378 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  41.64 
 
 
360 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  45.08 
 
 
370 aa  262  8e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  36 
 
 
383 aa  234  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3087  peptidase dimerization domain protein  40.43 
 
 
387 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  33.42 
 
 
402 aa  192  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5236  peptidase M20  32.13 
 
 
403 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3698  putative peptidase  30.61 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.704745  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0648  peptidase T  29.89 
 
 
415 aa  106  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2574  peptidase T  27.46 
 
 
411 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0800  peptidase T  25.58 
 
 
407 aa  102  9e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1096  peptidase T  26.33 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2943  peptidase T  27.32 
 
 
407 aa  97.8  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  26.63 
 
 
410 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5117  peptidase T  27.05 
 
 
412 aa  96.3  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.24 
 
 
396 aa  96.3  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2393  peptidase dimerisation domain protein  28.88 
 
 
402 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000137501  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3250  peptidase T  27.29 
 
 
409 aa  94  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4406  peptidase T  29.86 
 
 
414 aa  92.8  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554315  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.6 
 
 
442 aa  92.8  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1069  peptidase T  24.7 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1057  peptidase T  25.65 
 
 
402 aa  91.7  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  25.92 
 
 
414 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4006  peptidase T  26.38 
 
 
409 aa  90.9  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000311965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4565  peptidase T  25.49 
 
 
418 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.45 
 
 
394 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0101  peptidase T  25.36 
 
 
417 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0461274  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1640  peptidase T  25.89 
 
 
422 aa  90.9  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  28.53 
 
 
409 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  27.51 
 
 
408 aa  90.9  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1893  peptidase T  27.51 
 
 
417 aa  90.5  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  25.49 
 
 
407 aa  90.5  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  30.16 
 
 
372 aa  90.5  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  29.82 
 
 
422 aa  89.7  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2425  peptidase T  26.92 
 
 
420 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91324  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4149  peptidase T  28.17 
 
 
410 aa  89.7  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  27.94 
 
 
386 aa  89.7  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2074  peptidase T  25.48 
 
 
409 aa  88.6  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  27.22 
 
 
422 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  27.89 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.36 
 
 
402 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  27.22 
 
 
422 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  25.75 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  25.75 
 
 
408 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  27.51 
 
 
408 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1115  peptidase T  26.69 
 
 
418 aa  87  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  27.16 
 
 
374 aa  86.7  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  27.51 
 
 
408 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2224  peptidase T  26.65 
 
 
417 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  27.51 
 
 
408 aa  87  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  27.51 
 
 
408 aa  87  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6760  peptidase T  27.78 
 
 
410 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205278  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09630  peptidase T  27.43 
 
 
408 aa  86.3  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0155  peptidase T  24.82 
 
 
420 aa  85.9  9e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1755  peptidase M20  27.73 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08441  peptidase T  23.88 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0166  peptidase T  24.56 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2148  peptidase T  25.3 
 
 
410 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  27.13 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  29.44 
 
 
389 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  28.73 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1206  peptidase T  26.78 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.44823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>