More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2568 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  100 
 
 
376 aa  752    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3034  peptidase T-like protein  56.71 
 
 
374 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  43.17 
 
 
375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  43.72 
 
 
372 aa  301  9e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  46.03 
 
 
368 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  43.17 
 
 
374 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  43.56 
 
 
368 aa  291  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  41.26 
 
 
377 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  41.21 
 
 
368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  41.58 
 
 
377 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4216  peptidase T  42.08 
 
 
372 aa  289  7e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00206895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  41.8 
 
 
372 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  41.8 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  41.8 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  41.8 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  41.8 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  41.8 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  41.8 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  41.8 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  41.8 
 
 
372 aa  286  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  38.9 
 
 
370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  42.08 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  40.43 
 
 
377 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  40.43 
 
 
377 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  42.05 
 
 
389 aa  276  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  39.4 
 
 
365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  38.52 
 
 
372 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  44 
 
 
372 aa  268  8e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  37.13 
 
 
374 aa  266  4e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  42.74 
 
 
368 aa  266  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  39.39 
 
 
368 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  39.94 
 
 
381 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  38.11 
 
 
391 aa  257  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  39.13 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  39.39 
 
 
375 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  39.4 
 
 
368 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  41.27 
 
 
360 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  36.61 
 
 
368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  39.47 
 
 
378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  33.33 
 
 
383 aa  235  8e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  37 
 
 
379 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  39.95 
 
 
370 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3087  peptidase dimerization domain protein  36.9 
 
 
387 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  29.2 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5236  peptidase M20  32.25 
 
 
403 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3698  putative peptidase  27.97 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.704745  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  28.85 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  24.87 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  27.02 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3404  peptidase T  29.82 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  24.65 
 
 
422 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  25.24 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  26.25 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0275  acetylornithine deacetylase  27.57 
 
 
401 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4406  peptidase T  25.9 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  27.52 
 
 
380 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  29.15 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0029  peptidase T  26.39 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000506  tripeptide aminopeptidase  25.43 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0029  peptidase T  26.74 
 
 
406 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  26.67 
 
 
423 aa  76.3  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0529  peptidase T  23.24 
 
 
408 aa  76.3  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00086333  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1069  peptidase T  22.66 
 
 
414 aa  76.3  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5117  peptidase T  25.26 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1115  peptidase T  26.03 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  23.33 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  26.2 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2574  peptidase T  26.46 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  23.33 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  23.33 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  23.33 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  26.62 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0800  peptidase T  22.18 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  23.08 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  23.08 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  23.08 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  23.08 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2396  peptidase T  27.21 
 
 
427 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0937974 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0516  aminoacyl-histidine dipeptidase  28.12 
 
 
492 aa  71.6  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4006  peptidase T  26.06 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000311965 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2139  peptidase T  25.72 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.359418  normal  0.0575573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0648  peptidase T  27.84 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1306  peptidase T  25.28 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.841149  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1957  peptidase T  25.28 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.355866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4565  peptidase T  25.7 
 
 
418 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1344  peptidase T  25.28 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.595235 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0155  peptidase T  24.09 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1328  peptidase T  25.28 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.245439 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  23.08 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2074  peptidase T  23.24 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1096  peptidase T  25.5 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05384  peptidase T  26.94 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5848  peptidase T  27.76 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362354  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.42 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2205  peptidase T  22.22 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2224  peptidase T  26.06 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34281  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.42 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  27.49 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1442  peptidase M20  29.13 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4149  peptidase T  27.11 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.399065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>