222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3698 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3698  putative peptidase  100 
 
 		 401 aa  819    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.704745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  52.39 
 
 		 402 aa  423  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5236  peptidase M20  55.5 
 
 		 403 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  28.61 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  28.89 
 
 		 368 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  29.37 
 
 		 375 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  28.68 
 
 		 375 aa  143  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  28.49 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  30.61 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  28.11 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  30.26 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  27.72 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  31.36 
 
 		 372 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  26.46 
 
 		 370 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  27.92 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  31.36 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  31.36 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  31.36 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  31.36 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  31.36 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  31.36 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  30.85 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4216  peptidase T  30.85 
 
 		 372 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00206895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  30.85 
 
 		 372 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  30.05 
 
 		 377 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  30.85 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  27.46 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  28.35 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  27.46 
 
 		 389 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  26.97 
 
 		 365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3034  peptidase T-like protein  29.82 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  25.77 
 
 		 391 aa  125  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  28.9 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  27.97 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  26.18 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  25.8 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  26.3 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  28.13 
 
 		 372 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  29.8 
 
 		 368 aa  117  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  28.39 
 
 		 379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  30.28 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  27.81 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  25.93 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  25.93 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  26.11 
 
 		 368 aa  97.1  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3087  peptidase dimerization domain protein  26.67 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  25.67 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  28.15 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  22.15 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0101  peptidase T  22.43 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0461274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5117  peptidase T  22.81 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1922  peptidase T  23.57 
 
 		 411 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  28.08 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2396  peptidase T  24.73 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0937974 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0529  peptidase T  21.13 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00086333  normal  0.062594 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  22.61 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0748  peptidase T  23.92 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.27 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0800  peptidase T  21.68 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  22.33 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6760  peptidase T  24.6 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205278  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  22.38 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  22.38 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  22.38 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  22.38 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  22.38 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  22.38 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  27.09 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  22.38 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2569  peptidase T  24.71 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2148  peptidase T  22.66 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5848  peptidase T  21.87 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  21.75 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  21.85 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0029  peptidase T  21.68 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4565  peptidase T  21.67 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0029  peptidase T  21.82 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3303  peptidase T  24.21 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3404  peptidase T  24.54 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2224  peptidase T  22.25 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34281  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0648  peptidase T  23.26 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2890  peptidase T  23.53 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.223061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1328  peptidase T  21.91 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.245439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1344  peptidase T  21.91 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.595235 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0945  peptidase T  20.72 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3349  peptidase T  22.77 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0105753  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  24.78 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1893  peptidase T  20.64 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1863  peptidase T  23.23 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264839  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2411  peptidase T  20.57 
 
 		 410 aa  57  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.825579  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.59 
 
 		 388 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1957  peptidase T  21.68 
 
 		 409 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.355866  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1306  peptidase T  21.68 
 
 		 409 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.841149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2139  peptidase T  21.91 
 
 		 409 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.359418  normal  0.0575573 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.41 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  23.75 
 
 		 409 aa  56.2  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3775  peptidase T  21.61 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.524729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  30.52 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  24.47 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  23.51 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>