188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2569 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1893  peptidase T  75.06 
 
 		 417 aa  660    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2569  peptidase T  100 
 
 		 420 aa  858    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2396  peptidase T  81.93 
 
 		 427 aa  712    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0937974 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2890  peptidase T  89.74 
 
 		 430 aa  780    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.223061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2224  peptidase T  76.27 
 
 		 417 aa  668    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34281  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3303  peptidase T  83.33 
 
 		 417 aa  699    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4565  peptidase T  76.39 
 
 		 418 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6760  peptidase T  68.86 
 
 		 410 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5848  peptidase T  68.61 
 
 		 410 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0101  peptidase T  64.16 
 
 		 417 aa  567  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0461274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2425  peptidase T  65.44 
 
 		 420 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91324  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1922  peptidase T  67.32 
 
 		 411 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5117  peptidase T  64.37 
 
 		 412 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  62.04 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_002950  PG0445  peptidase T  50.74 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0466341 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2574  peptidase T  48.28 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  47.42 
 
 		 410 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3224  peptidase T  48.77 
 
 		 410 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.525906  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08441  peptidase T  47.01 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000506  tripeptide aminopeptidase  48.03 
 
 		 412 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  46.44 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05384  peptidase T  46.31 
 
 		 413 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09630  peptidase T  47.29 
 
 		 408 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1206  peptidase T  45.57 
 
 		 414 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.44823  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  48.17 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0029  peptidase T  46.31 
 
 		 406 aa  378  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0029  peptidase T  46.55 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3349  peptidase T  46.65 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0105753  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0399  peptidase T  47.42 
 
 		 409 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.168902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3791  peptidase T  45.45 
 
 		 410 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2205  peptidase T  45.32 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3775  peptidase T  45.45 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.524729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3488  peptidase T  45.21 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.25106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3500  peptidase T  45.21 
 
 		 412 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1456  peptidase T  45.7 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2411  peptidase T  44.96 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.825579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3754  peptidase T  45.21 
 
 		 410 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000202819 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3512  peptidase T  45.7 
 
 		 410 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3588  peptidase T  44.96 
 
 		 410 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3872  peptidase T  44.96 
 
 		 410 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3843  peptidase T  45.45 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3404  peptidase T  48.16 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0648  peptidase T  47.52 
 
 		 415 aa  363  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1096  peptidase T  48.49 
 
 		 410 aa  361  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1942  peptidase T  45.43 
 
 		 417 aa  356  5e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.366024  normal  0.129304 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2943  peptidase T  44.09 
 
 		 407 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0925  peptidase T  45.61 
 
 		 401 aa  351  2e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000393366  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0529  peptidase T  42.65 
 
 		 408 aa  338  7e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00086333  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0767  peptidase T  43.83 
 
 		 408 aa  332  8e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0758146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0784  peptidase T  43.83 
 
 		 408 aa  332  8e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0685996  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0772  peptidase T  43.98 
 
 		 411 aa  332  1e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.340472  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  43.14 
 
 		 423 aa  331  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0748  peptidase T  42.79 
 
 		 416 aa  330  2e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4006  peptidase T  43.49 
 
 		 409 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000311965 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1996  peptidase T  42.36 
 
 		 413 aa  328  8e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  42.18 
 
 		 408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4149  peptidase T  42.08 
 
 		 410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1712  peptidase T  41.67 
 
 		 411 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1605  peptidase T  41.67 
 
 		 411 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.888107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2858  peptidase T  41.67 
 
 		 411 aa  327  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  41.36 
 
 		 422 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  41.36 
 
 		 422 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1640  peptidase T  41.67 
 
 		 422 aa  325  6e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  41.94 
 
 		 409 aa  325  9e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2069  peptidase T  41.44 
 
 		 423 aa  325  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  41.94 
 
 		 408 aa  324  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1863  peptidase T  42.18 
 
 		 410 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264839  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  41.69 
 
 		 408 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  41.69 
 
 		 408 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  41.69 
 
 		 408 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  41.69 
 
 		 408 aa  323  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3250  peptidase T  42.79 
 
 		 409 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  41.42 
 
 		 409 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2148  peptidase T  42.18 
 
 		 410 aa  320  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1957  peptidase T  42.43 
 
 		 409 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.355866  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1306  peptidase T  42.43 
 
 		 409 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.841149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1057  peptidase T  40.75 
 
 		 402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2139  peptidase T  42.18 
 
 		 409 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.359418  normal  0.0575573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1328  peptidase T  42.43 
 
 		 409 aa  319  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.245439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1344  peptidase T  42.43 
 
 		 409 aa  319  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.595235 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0410  peptidase T  42.25 
 
 		 412 aa  315  8e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.88832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1389  peptidase T  42.61 
 
 		 406 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0424518  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1094  peptidase T  44.61 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.357945  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1109  peptidase T  39.75 
 
 		 415 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0155  peptidase T  40.79 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0945  peptidase T  39.41 
 
 		 406 aa  286  4e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0998  peptidase T  38.61 
 
 		 407 aa  285  8e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.109897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1115  peptidase T  37.62 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4406  peptidase T  38.42 
 
 		 414 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554315  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1652  peptidase T  34.83 
 
 		 425 aa  268  1e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0264694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2074  peptidase T  37.07 
 
 		 409 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0953  peptidase T  36.1 
 
 		 416 aa  253  3e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000027828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1069  peptidase T  35.04 
 
 		 414 aa  251  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3359  peptidase T  38.97 
 
 		 410 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0166  peptidase T  35.29 
 
 		 414 aa  246  8e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0680  peptidase T  37.28 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0749  peptidase T  37.28 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1530  peptidase T  36.6 
 
 		 411 aa  239  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1193  peptidase T  37.38 
 
 		 409 aa  239  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1976  peptidase T  34.38 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.371679  normal  0.99083 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>