More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0595 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  100 
 
 		 375 aa  756    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  46.79 
 
 		 375 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  47.51 
 
 		 377 aa  322  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  48.5 
 
 		 368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  42.39 
 
 		 370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  43.16 
 
 		 372 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  43.16 
 
 		 372 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  43.16 
 
 		 372 aa  300  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  43.16 
 
 		 372 aa  300  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  43.16 
 
 		 372 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  43.16 
 
 		 372 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  43.16 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  43.43 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  43.43 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4216  peptidase T  43.16 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00206895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  43.16 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  43.43 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  43.28 
 
 		 374 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  38.65 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  41.03 
 
 		 368 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  38.15 
 
 		 368 aa  276  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  40.27 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  40.27 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  44.26 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3034  peptidase T-like protein  41.19 
 
 		 374 aa  262  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  38.07 
 
 		 377 aa  262  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  40.87 
 
 		 365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  37.7 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  39.02 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  37.7 
 
 		 391 aa  252  7e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  39.89 
 
 		 381 aa  249  6e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  37.74 
 
 		 368 aa  243  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  40.88 
 
 		 360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  39.57 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  39.39 
 
 		 376 aa  239  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  38.4 
 
 		 368 aa  237  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  38.46 
 
 		 379 aa  233  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  36.91 
 
 		 368 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  37.85 
 
 		 368 aa  232  9e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  37.06 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  33.78 
 
 		 383 aa  226  4e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  38.62 
 
 		 378 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3087  peptidase dimerization domain protein  35.71 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  29.23 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5236  peptidase M20  33.25 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3698  putative peptidase  28.68 
 
 		 401 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.704745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  25.33 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0648  peptidase T  26.04 
 
 		 415 aa  99.8  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3404  peptidase T  26.95 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5117  peptidase T  28.21 
 
 		 412 aa  92.8  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1893  peptidase T  27.22 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0800  peptidase T  23.92 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4406  peptidase T  27.78 
 
 		 414 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554315  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3250  peptidase T  24.46 
 
 		 409 aa  89.7  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2943  peptidase T  25.36 
 
 		 407 aa  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1306  peptidase T  24.12 
 
 		 409 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.841149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1957  peptidase T  24.12 
 
 		 409 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.355866  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1328  peptidase T  24.12 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.245439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  23.14 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2425  peptidase T  25.8 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91324  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2224  peptidase T  26.39 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34281  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2139  peptidase T  23.89 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.359418  normal  0.0575573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1344  peptidase T  24.12 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.595235 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1640  peptidase T  25.94 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2574  peptidase T  24.2 
 
 		 411 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1115  peptidase T  24.74 
 
 		 418 aa  87  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  25.34 
 
 		 408 aa  86.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  27.18 
 
 		 409 aa  86.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  28.57 
 
 		 394 aa  86.3  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0101  peptidase T  24.29 
 
 		 417 aa  86.3  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0461274  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  25.25 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2569  peptidase T  26.24 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2396  peptidase T  26.61 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0937974 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1652  peptidase T  26.88 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0264694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1057  peptidase T  27.12 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  21.34 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  25.25 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  25.25 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  25.25 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  26 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  26 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6760  peptidase T  28.18 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  26 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  26 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  27.01 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1377  peptidase T  22.76 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  25.44 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05384  peptidase T  25.77 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  26.93 
 
 		 376 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2890  peptidase T  25 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.223061 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0529  peptidase T  23.7 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00086333  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2069  peptidase T  25.61 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1863  peptidase T  25.17 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264839  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5848  peptidase T  24.26 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1096  peptidase T  23.49 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  29.48 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4565  peptidase T  24.85 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2074  peptidase T  23.88 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  27.52 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1922  peptidase T  25.13 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>