More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1092 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  100 
 
 		 377 aa  744    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  58.67 
 
 		 375 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  49.19 
 
 		 370 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  49.86 
 
 		 368 aa  335  5.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  49.19 
 
 		 372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  47.51 
 
 		 375 aa  322  5e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  48.65 
 
 		 372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  46.4 
 
 		 377 aa  319  6e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  48.38 
 
 		 372 aa  318  9e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  48.38 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  46.72 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4216  peptidase T  48.38 
 
 		 372 aa  317  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00206895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  48.38 
 
 		 372 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  48.38 
 
 		 372 aa  317  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  48.38 
 
 		 372 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  48.38 
 
 		 372 aa  316  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  48.38 
 
 		 372 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  48.38 
 
 		 372 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  48.38 
 
 		 372 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  46.58 
 
 		 381 aa  315  7e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  48.11 
 
 		 374 aa  315  8e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  45.92 
 
 		 391 aa  315  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  45.28 
 
 		 368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  45.95 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  46.15 
 
 		 368 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  45.41 
 
 		 378 aa  309  5e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  47.03 
 
 		 372 aa  308  8e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  45.6 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  47.57 
 
 		 372 aa  295  6e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  45.05 
 
 		 368 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  42.78 
 
 		 377 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  42.78 
 
 		 377 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  44.57 
 
 		 360 aa  286  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  42.9 
 
 		 365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  41.11 
 
 		 374 aa  282  7.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  41.58 
 
 		 376 aa  279  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3034  peptidase T-like protein  43.97 
 
 		 374 aa  276  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  45.31 
 
 		 368 aa  272  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  41.19 
 
 		 370 aa  267  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  42.33 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  39.68 
 
 		 389 aa  255  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  38.26 
 
 		 383 aa  249  7e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3087  peptidase dimerization domain protein  34.19 
 
 		 387 aa  186  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  32.08 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5236  peptidase M20  32.34 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3698  putative peptidase  30.05 
 
 		 401 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.704745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5117  peptidase T  25.71 
 
 		 412 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1640  peptidase T  27.45 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  27.55 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2574  peptidase T  28.27 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  26.01 
 
 		 414 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5848  peptidase T  26.67 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0800  peptidase T  26.03 
 
 		 407 aa  111  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  26.79 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  26.79 
 
 		 422 aa  109  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  26.79 
 
 		 422 aa  109  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  27.14 
 
 		 407 aa  109  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  26.79 
 
 		 409 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6760  peptidase T  27.08 
 
 		 410 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205278  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  26.56 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  26.56 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2425  peptidase T  26.21 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91324  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  26.73 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  26.56 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2224  peptidase T  25.82 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34281  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  26.56 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2069  peptidase T  26.57 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4406  peptidase T  24.64 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554315  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0529  peptidase T  26.67 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00086333  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1863  peptidase T  26.68 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264839  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0166  peptidase T  26.08 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3224  peptidase T  28.81 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.525906  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1893  peptidase T  25.06 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1922  peptidase T  26.54 
 
 		 411 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2205  peptidase T  28.74 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2943  peptidase T  25 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3250  peptidase T  24.82 
 
 		 409 aa  103  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  26.02 
 
 		 422 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08441  peptidase T  26.17 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2396  peptidase T  25.94 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0937974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3303  peptidase T  26.24 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2890  peptidase T  25.54 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.223061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2569  peptidase T  25.3 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2411  peptidase T  27.12 
 
 		 410 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.825579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0101  peptidase T  25.4 
 
 		 417 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0461274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4565  peptidase T  25.06 
 
 		 418 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  26.32 
 
 		 423 aa  99.4  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1377  peptidase T  26.89 
 
 		 410 aa  97.4  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1115  peptidase T  26.4 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  23.56 
 
 		 409 aa  97.1  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1456  peptidase T  27.02 
 
 		 410 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3512  peptidase T  27.02 
 
 		 410 aa  96.3  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822323  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2858  peptidase T  24.31 
 
 		 411 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2148  peptidase T  25.48 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1712  peptidase T  24.31 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1344  peptidase T  25.37 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.595235 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1328  peptidase T  25.37 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.245439 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0029  peptidase T  27.29 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1605  peptidase T  24.31 
 
 		 411 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.888107  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2074  peptidase T  24.05 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>