More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2778 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  100 
 
 		 372 aa  741    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  51.77 
 
 		 372 aa  350  2e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  50.14 
 
 		 368 aa  345  8.999999999999999e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  49.86 
 
 		 381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  49.72 
 
 		 368 aa  342  5e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  49.58 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  49.03 
 
 		 391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  50.14 
 
 		 368 aa  338  8e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  49.19 
 
 		 377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  46.32 
 
 		 370 aa  325  9e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  47.85 
 
 		 374 aa  318  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  48.24 
 
 		 372 aa  317  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  45.92 
 
 		 375 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  42.35 
 
 		 368 aa  315  7e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  46.07 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4216  peptidase T  46.07 
 
 		 372 aa  309  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00206895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  46.07 
 
 		 372 aa  309  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  46.07 
 
 		 372 aa  306  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  45.53 
 
 		 372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  45.53 
 
 		 372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  45.53 
 
 		 372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  45.53 
 
 		 372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  45.53 
 
 		 372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  45.53 
 
 		 372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  45.8 
 
 		 372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  43.6 
 
 		 368 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  44.77 
 
 		 377 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  44.77 
 
 		 377 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  43.24 
 
 		 389 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  42.9 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  42.9 
 
 		 374 aa  290  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  42.74 
 
 		 360 aa  285  7e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  38.65 
 
 		 375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  38.31 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  40.48 
 
 		 378 aa  272  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  39.67 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3034  peptidase T-like protein  40.72 
 
 		 374 aa  266  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  41.21 
 
 		 368 aa  265  8e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  38.52 
 
 		 376 aa  263  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  40.16 
 
 		 379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  39.78 
 
 		 365 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  38.13 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3087  peptidase dimerization domain protein  32.16 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  30.47 
 
 		 402 aa  169  9e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5236  peptidase M20  30.59 
 
 		 403 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3698  putative peptidase  27.92 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.704745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  24.21 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2943  peptidase T  26.3 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2074  peptidase T  27.53 
 
 		 409 aa  95.9  9e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2425  peptidase T  24.65 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91324  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  25.18 
 
 		 422 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4406  peptidase T  27.53 
 
 		 414 aa  93.6  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554315  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1069  peptidase T  25.06 
 
 		 414 aa  93.2  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08441  peptidase T  27.32 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  26.78 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  27.1 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2574  peptidase T  25.78 
 
 		 411 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  26.56 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1893  peptidase T  24.59 
 
 		 417 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0166  peptidase T  24.53 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1057  peptidase T  26.63 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0800  peptidase T  23.83 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  24.36 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  24.36 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0101  peptidase T  24.21 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0461274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  24.59 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  24.36 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  24.36 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  24.36 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  24.36 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1652  peptidase T  24.71 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0264694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1640  peptidase T  24.52 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  27.65 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  29.08 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1957  peptidase T  24.46 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.355866  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1306  peptidase T  24.46 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.841149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1115  peptidase T  25.41 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  24.36 
 
 		 408 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1328  peptidase T  24.46 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.245439 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2139  peptidase T  24.22 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.359418  normal  0.0575573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1344  peptidase T  24.46 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.595235 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2411  peptidase T  25.12 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.825579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5117  peptidase T  24.52 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2224  peptidase T  24.58 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34281  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000506  tripeptide aminopeptidase  26.92 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  24.36 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  26.65 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1922  peptidase T  24.47 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2890  peptidase T  24.82 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.223061 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0029  peptidase T  26.3 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0029  peptidase T  26.68 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4565  peptidase T  24.64 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3250  peptidase T  24.82 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  30.34 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0945  peptidase T  26.48 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  23.37 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0155  peptidase T  23.93 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  29.14 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2569  peptidase T  24.58 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2069  peptidase T  23.15 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>