More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1507 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  100 
 
 		 402 aa  828    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5236  peptidase M20  56.17 
 
 		 403 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3698  putative peptidase  52.39 
 
 		 401 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.704745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  33.42 
 
 		 368 aa  192  9e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  31.28 
 
 		 375 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  32 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  34.85 
 
 		 372 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  35.1 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  35.1 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  35.1 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  35.1 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  35.1 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  31.33 
 
 		 377 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  35.1 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  35.1 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4216  peptidase T  35.1 
 
 		 372 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00206895  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  30.65 
 
 		 383 aa  176  7e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  30.03 
 
 		 391 aa  176  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  35.1 
 
 		 372 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  35.1 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  29.23 
 
 		 375 aa  172  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  32.08 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  28.12 
 
 		 368 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  31.78 
 
 		 374 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  30.47 
 
 		 372 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  29.66 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  31.5 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  33.33 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  29.62 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  33.58 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  30.31 
 
 		 368 aa  163  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3034  peptidase T-like protein  34.03 
 
 		 374 aa  163  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  28.72 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  29.74 
 
 		 370 aa  160  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  31.38 
 
 		 377 aa  159  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  31.38 
 
 		 377 aa  159  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  31.11 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  33.23 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  29.09 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  29.11 
 
 		 389 aa  149  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  29.62 
 
 		 370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  29.2 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  30.41 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  30.47 
 
 		 379 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  28.8 
 
 		 368 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3087  peptidase dimerization domain protein  26.28 
 
 		 387 aa  96.3  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  29.86 
 
 		 422 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2396  peptidase T  26.35 
 
 		 427 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0937974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2569  peptidase T  27.42 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.226683 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  24.07 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  25.83 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2943  peptidase T  25.34 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  23.86 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  24.34 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  24.34 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  24.34 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  24.34 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  24.07 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  24.07 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  24.07 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2890  peptidase T  24.23 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.223061 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1863  peptidase T  23.66 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0101  peptidase T  24.88 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0461274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1893  peptidase T  24.32 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2148  peptidase T  24.33 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.82 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  24.41 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  25.51 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4149  peptidase T  25.74 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2069  peptidase T  22.6 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0155  peptidase T  26.07 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  24.23 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0648  peptidase T  23.32 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4565  peptidase T  23.76 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3303  peptidase T  24.86 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1922  peptidase T  25.25 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2224  peptidase T  23.97 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34281  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0029  peptidase T  24.65 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  27.3 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1530  peptidase T  23.71 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2425  peptidase T  23.28 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91324  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1712  peptidase T  23.43 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2858  peptidase T  23.43 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1605  peptidase T  23.43 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.888107  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0529  peptidase T  25.68 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00086333  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0166  peptidase T  24.25 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5848  peptidase T  23.94 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1069  peptidase T  23.13 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1096  peptidase T  25.44 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1389  peptidase T  26.79 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0424518  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3404  peptidase T  24.21 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  22.73 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05384  peptidase T  21.88 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000506  tripeptide aminopeptidase  24.58 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  27.39 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  26.52 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0953  peptidase T  27.24 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000027828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3359  peptidase T  26.65 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4406  peptidase T  23.91 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2030  peptidase M42 family protein  27.91 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>