More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3485 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  100 
 
 		 368 aa  744    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  42.58 
 
 		 368 aa  275  9e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  45.31 
 
 		 377 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  43.02 
 
 		 370 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  42.58 
 
 		 368 aa  266  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  41.21 
 
 		 372 aa  265  7e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  42.47 
 
 		 391 aa  263  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  41.8 
 
 		 368 aa  260  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  41.26 
 
 		 368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  41.76 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  43.13 
 
 		 375 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  42.22 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  41.37 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  40.16 
 
 		 365 aa  250  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  37.91 
 
 		 368 aa  250  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  38.25 
 
 		 360 aa  239  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3034  peptidase T-like protein  38.57 
 
 		 374 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  36.61 
 
 		 376 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  39.45 
 
 		 372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  36.91 
 
 		 375 aa  232  7.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  38.42 
 
 		 377 aa  232  9e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  40.23 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  39.89 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  35.31 
 
 		 377 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  35.31 
 
 		 377 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  36.89 
 
 		 389 aa  226  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  38.08 
 
 		 372 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  38.08 
 
 		 372 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  38.08 
 
 		 372 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  38.08 
 
 		 372 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  38.08 
 
 		 372 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  38.08 
 
 		 372 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  38.08 
 
 		 372 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  38.08 
 
 		 372 aa  216  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4216  peptidase T  38.08 
 
 		 372 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00206895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  38.08 
 
 		 372 aa  215  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  37.81 
 
 		 372 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  33.6 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  36.04 
 
 		 370 aa  207  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  35.71 
 
 		 378 aa  205  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  35.71 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  29.76 
 
 		 383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3087  peptidase dimerization domain protein  32.5 
 
 		 387 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  28.8 
 
 		 402 aa  129  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5236  peptidase M20  27.18 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3698  putative peptidase  26.11 
 
 		 401 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.704745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  27.03 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1069  peptidase T  25.53 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2393  peptidase dimerisation domain protein  27.45 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000137501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  32.07 
 
 		 420 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  27.74 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  29.39 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  20.9 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0166  peptidase T  26.92 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  26.08 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2069  peptidase T  28.92 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  26.76 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1057  peptidase T  25.45 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0800  peptidase T  25.7 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  27.27 
 
 		 409 aa  67  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2411  peptidase T  23.99 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.825579  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  23.51 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  25.49 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1863  peptidase T  27.2 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264839  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1640  peptidase T  28.4 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1755  peptidase M20  31.58 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  23.99 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  25.71 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  23.05 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  26.28 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  25.41 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0880  amidohydrolase  25.99 
 
 		 424 aa  62.8  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.555693  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  33.59 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  33.59 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  33.59 
 
 		 408 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  33.59 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0529  peptidase T  24.66 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00086333  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  33.59 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  23.68 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  33.59 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  33.59 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  33.59 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  25.79 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  33.59 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  25.79 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  25.14 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  25.93 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  25.89 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4406  peptidase T  25 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  25.38 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2396  peptidase T  26.79 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0937974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  25.51 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1605  peptidase T  34.55 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.888107  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  23.67 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1712  peptidase T  34.55 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1652  peptidase T  25.43 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0264694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2858  peptidase T  34.55 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2030  peptidase M42 family protein  35.71 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  25.38 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000506  tripeptide aminopeptidase  27.14 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>