197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2393 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2393  peptidase dimerisation domain protein  100 
 
 
402 aa  822    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000137501  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3696  peptidase M20  46.53 
 
 
452 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  45.71 
 
 
461 aa  329  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5278  peptidase M20  42.71 
 
 
454 aa  292  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3346  peptidase M20  40.91 
 
 
453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0581129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3913  peptidase M20  40.4 
 
 
440 aa  273  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.806935  normal  0.526735 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  43.06 
 
 
403 aa  268  8.999999999999999e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1442  peptidase M20  39.05 
 
 
417 aa  250  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0276  peptidase M20  39.71 
 
 
361 aa  206  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0805  peptidase M20  33.14 
 
 
344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2509  peptidase M20  32.47 
 
 
337 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2861  hypothetical protein  27.32 
 
 
389 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.175603  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  28.88 
 
 
368 aa  94.7  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  29.81 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  29.84 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.83 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  29.92 
 
 
372 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  26.11 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  27.48 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  25.89 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  26.61 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  26.28 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  27.45 
 
 
368 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.67 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.99 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  29.61 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  29.41 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  26.56 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  26.65 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  26.74 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  26.28 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  26.02 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  27.3 
 
 
368 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  26.09 
 
 
368 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  25.35 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  25.35 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  26.34 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  28.3 
 
 
370 aa  62.8  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  27.56 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  27.88 
 
 
376 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  25 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  27.27 
 
 
374 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.39 
 
 
378 aa  61.6  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.25 
 
 
371 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  23.39 
 
 
434 aa  60.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  28.99 
 
 
376 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  25 
 
 
389 aa  60.1  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  29.8 
 
 
441 aa  59.7  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  25 
 
 
376 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  26.03 
 
 
388 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.23 
 
 
374 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0317  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.59 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  26.33 
 
 
372 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  26.03 
 
 
388 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  25 
 
 
383 aa  58.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  23.92 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  27.3 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  27.3 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  24.23 
 
 
411 aa  58.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  24.73 
 
 
368 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  27.13 
 
 
388 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.02 
 
 
394 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.16 
 
 
378 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.19 
 
 
353 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  26.11 
 
 
360 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  25.07 
 
 
409 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  28.21 
 
 
485 aa  57  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.42 
 
 
363 aa  56.6  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  27.84 
 
 
391 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  25.22 
 
 
416 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  32.04 
 
 
394 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.77 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  26.56 
 
 
376 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  28.3 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.63 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  26.44 
 
 
375 aa  54.7  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  24.46 
 
 
376 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  26.55 
 
 
374 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  22.15 
 
 
364 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  26.32 
 
 
375 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  25.1 
 
 
436 aa  54.3  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  25.75 
 
 
370 aa  54.3  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.21 
 
 
359 aa  53.9  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.57 
 
 
349 aa  54.3  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  24.22 
 
 
434 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2048  acetylornithine deacetylase  26.56 
 
 
418 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  26.95 
 
 
377 aa  53.5  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  25.15 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  26.14 
 
 
443 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  25.74 
 
 
413 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  26.87 
 
 
372 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.64 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  22.19 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  28.77 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  21.97 
 
 
362 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  26.23 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  24.77 
 
 
411 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  24.25 
 
 
376 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  25.35 
 
 
372 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  25.16 
 
 
394 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>