More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2929 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 394 aa  777    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  68.35 
 
 		 359 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  66.76 
 
 		 371 aa  449  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.52 
 
 		 378 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.95 
 
 		 374 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.95 
 
 		 371 aa  401  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.63 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.31 
 
 		 378 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.91 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.24 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.62 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.7 
 
 		 354 aa  364  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.73 
 
 		 371 aa  362  8e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.88 
 
 		 369 aa  357  2.9999999999999997e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.59 
 
 		 351 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.19 
 
 		 354 aa  348  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.59 
 
 		 353 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.83 
 
 		 401 aa  345  7e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.46 
 
 		 358 aa  345  8.999999999999999e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.13 
 
 		 367 aa  345  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.68 
 
 		 357 aa  342  5.999999999999999e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.3 
 
 		 378 aa  342  7e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  56.11 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.86 
 
 		 357 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.39 
 
 		 359 aa  332  5e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.89 
 
 		 375 aa  330  4e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.08 
 
 		 358 aa  329  6e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.13 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.8 
 
 		 354 aa  327  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.99 
 
 		 364 aa  325  8.000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.09 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.09 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.09 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.27 
 
 		 356 aa  316  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.97 
 
 		 354 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.71 
 
 		 356 aa  213  5.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.75 
 
 		 354 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  39.34 
 
 		 344 aa  196  7e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40 
 
 		 361 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.1 
 
 		 368 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.39 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.52 
 
 		 368 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  33.89 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.17 
 
 		 398 aa  95.5  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.45 
 
 		 366 aa  91.3  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  32.89 
 
 		 410 aa  87  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  27.68 
 
 		 365 aa  86.3  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  31.23 
 
 		 378 aa  86.3  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.25 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  30.03 
 
 		 428 aa  82.8  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.85 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  28.81 
 
 		 369 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  30.32 
 
 		 377 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  28.3 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.9 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  30.53 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.41 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  27.13 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3310  acetyl-lysine deacetylase  29.33 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  28.62 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  30.34 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  26.5 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  24.92 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  27.64 
 
 		 753 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  23.48 
 
 		 401 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  26.67 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  27.22 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  28.35 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0688  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.4 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  25.85 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  30 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.96 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.41 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  29.02 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.14 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.467708  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  28.76 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  25.65 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  26.73 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  26.99 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  27.99 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1267  peptidase  25.69 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  28.35 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  25.45 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  26.51 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  27.55 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  26.39 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05749  putative acetylornithine deacetylase (Eurofung)  25.77 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0187608 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  26.23 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  26.49 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  26.56 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  25.63 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  29.59 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1498  acetyl-lysine deacetylase  28.25 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.7 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.13 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  25.65 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  27.16 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  27.68 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>