More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3310 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3310  acetyl-lysine deacetylase  100 
 
 
351 aa  716    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2180  acetyl-lysine deacetylase  51.87 
 
 
348 aa  352  7e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.749889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3459  acetyl-lysine deacetylase  49.27 
 
 
352 aa  323  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2723  acetyl-lysine deacetylase  49.42 
 
 
366 aa  322  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1391  acetyl-lysine deacetylase  45.53 
 
 
358 aa  264  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.971431  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0317  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  39.02 
 
 
348 aa  263  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  40.63 
 
 
355 aa  237  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0347  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  39.71 
 
 
366 aa  232  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0324  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  38.87 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6288  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  39.89 
 
 
361 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0776  acetyl-lysine deacetylase  35.8 
 
 
351 aa  192  6e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.689856 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2612  acetyl-lysine deacetylase  35.81 
 
 
387 aa  186  6e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.880671  normal  0.701984 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1498  acetyl-lysine deacetylase  36.97 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1757  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  34.59 
 
 
383 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31.32 
 
 
375 aa  162  7e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0451  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31.64 
 
 
346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.02 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0867  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  30.21 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1861  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.81 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.29 
 
 
335 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1139  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  24.78 
 
 
346 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0335688  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0170  acetyl-lysine deacetylase  25.64 
 
 
345 aa  98.6  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000443828  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1259  acetylornithine deacetylase / N2-acetyl-L-lysine deacetylase  28.02 
 
 
335 aa  99  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.02 
 
 
385 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.38 
 
 
359 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.45 
 
 
375 aa  87.8  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3428  peptidase M20  25.07 
 
 
356 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00953913  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.33 
 
 
394 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  30.52 
 
 
344 aa  87  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  25.26 
 
 
386 aa  86.7  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.71 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0095  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.75 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.6 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.41 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.04 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0081  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.27 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  27.95 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.42 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2692  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.89 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310505  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  26.22 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4431  peptidase dimerisation domain protein  25.41 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0204618  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.95 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  26.42 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  27.95 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  27.95 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  27.95 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  26.22 
 
 
383 aa  79.3  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  27.95 
 
 
383 aa  79.3  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  27.95 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1372  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.05 
 
 
375 aa  79.3  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3141  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.05 
 
 
375 aa  79.3  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.2 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3087  acetylornithine deacetylase  25.34 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.12 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.31 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.37 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.53 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.42 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  27.67 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1255  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.05 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.12 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2849  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.12 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2716  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.12 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0930351 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2742  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.12 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.81 
 
 
378 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.41 
 
 
375 aa  77  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0474  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.93 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.23 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.24 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.24 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  27.4 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.88 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  20.42 
 
 
401 aa  76.3  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02363  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.89 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1198  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.89 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2751  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.89 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.53 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2618  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.89 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2602  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.89 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1915  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.16 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.89 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1205  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.89 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.270871  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02325  hypothetical protein  30.89 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1080  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.23 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4562  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.85 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.16 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.94 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1150  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.59 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.71 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2596  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.9 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.18 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  30.37 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3693  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.37 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.37 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  29.32 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.33 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2507  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.15 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.21 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2451  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.15 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.684558  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  24.35 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>