More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0661 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  100 
 
 
344 aa  661    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.44 
 
 
359 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.58 
 
 
353 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.41 
 
 
354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.76 
 
 
358 aa  230  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.86 
 
 
354 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.14 
 
 
354 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.27 
 
 
354 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.6 
 
 
367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.88 
 
 
354 aa  222  8e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.77 
 
 
369 aa  219  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.71 
 
 
358 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.13 
 
 
357 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.03 
 
 
354 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.43 
 
 
359 aa  209  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.49 
 
 
356 aa  208  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.13 
 
 
364 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.44 
 
 
366 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.35 
 
 
397 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.44 
 
 
366 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.44 
 
 
366 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.98 
 
 
359 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.23 
 
 
357 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.44 
 
 
394 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.11 
 
 
370 aa  205  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  41.86 
 
 
353 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.67 
 
 
371 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.87 
 
 
351 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.45 
 
 
374 aa  202  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.62 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.22 
 
 
371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.82 
 
 
371 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.18 
 
 
376 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.38 
 
 
375 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.63 
 
 
378 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.15 
 
 
378 aa  193  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.75 
 
 
356 aa  177  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.28 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.85 
 
 
401 aa  164  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  38.46 
 
 
368 aa  155  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.44 
 
 
361 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.88 
 
 
368 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.37 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.54 
 
 
368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3310  acetyl-lysine deacetylase  30.52 
 
 
351 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  30.03 
 
 
380 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  30.06 
 
 
368 aa  86.3  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  29.17 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  27 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1391  acetyl-lysine deacetylase  27.96 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.971431  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  25.89 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  28.8 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  27.15 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.08 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  25.82 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  27.56 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  26.65 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  28.13 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  26.41 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  30.9 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  26.72 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  30.75 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05749  putative acetylornithine deacetylase (Eurofung)  25.2 
 
 
424 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0187608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3374  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.22 
 
 
424 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  29.14 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  27.58 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  27.1 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4015  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  31.34 
 
 
413 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2318  peptidase M20  31.42 
 
 
449 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00838569  decreased coverage  0.00000161577 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2692  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.07 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310505  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  29.43 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0867  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.96 
 
 
338 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  30.94 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1541  peptidase M20  28.7 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  27.1 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  30.61 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.05 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  25.59 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0451  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31.59 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2196  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.37 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  27.83 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  27.16 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.24 
 
 
387 aa  69.3  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  29.11 
 
 
397 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.2 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0776  acetyl-lysine deacetylase  27.51 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.689856 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1531  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.27 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  27.69 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2502  acetylornithine deacetylase  31.28 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  27.32 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  27.24 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  25.57 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  26.27 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  26.57 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  26.27 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1823  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.12 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.248504  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.53 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.89 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  29.07 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>