More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5271 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  100 
 
 
368 aa  742    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.03 
 
 
368 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.47 
 
 
368 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.32 
 
 
368 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.28 
 
 
361 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.38 
 
 
356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.48 
 
 
354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.29 
 
 
359 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.5 
 
 
376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.37 
 
 
354 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.15 
 
 
375 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.04 
 
 
351 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.97 
 
 
357 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.02 
 
 
378 aa  194  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.16 
 
 
356 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.82 
 
 
367 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.92 
 
 
359 aa  192  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.25 
 
 
353 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.93 
 
 
357 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.07 
 
 
354 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.36 
 
 
358 aa  185  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.46 
 
 
369 aa  182  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.34 
 
 
371 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  38.12 
 
 
353 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.82 
 
 
371 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.06 
 
 
364 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.87 
 
 
371 aa  179  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.63 
 
 
374 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.63 
 
 
354 aa  179  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.39 
 
 
378 aa  179  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.15 
 
 
358 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.23 
 
 
370 aa  178  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.48 
 
 
354 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.77 
 
 
366 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.77 
 
 
366 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.77 
 
 
366 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.11 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.31 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.88 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.89 
 
 
394 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.12 
 
 
378 aa  170  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.43 
 
 
397 aa  169  9e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.16 
 
 
401 aa  161  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  36.79 
 
 
344 aa  143  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  29.45 
 
 
362 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.46 
 
 
395 aa  103  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  30.62 
 
 
369 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  23.88 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.75 
 
 
399 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  31.17 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.18 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  31.6 
 
 
364 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  30.46 
 
 
411 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.09 
 
 
387 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.03 
 
 
399 aa  90.1  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  27.71 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  31.17 
 
 
374 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  30.77 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.19 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  30.38 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  29.88 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  27.97 
 
 
375 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  27.63 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  28.73 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  29.68 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  29.14 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  29.87 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25.35 
 
 
422 aa  79.7  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  28.7 
 
 
402 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  29.27 
 
 
416 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  28.66 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.43 
 
 
407 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.43 
 
 
407 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  22.25 
 
 
382 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  24.66 
 
 
390 aa  77  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  29.23 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  29.38 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  28.7 
 
 
404 aa  75.9  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  28.3 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  28.88 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  28.81 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  28.44 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  24.67 
 
 
753 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  28.34 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  27.86 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2796  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.79 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.884075 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  29.64 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.26 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  29.34 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.38 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  28.09 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.83 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  27.24 
 
 
384 aa  73.6  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  26.23 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1857  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.33 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2121  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.33 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000264012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  28.09 
 
 
389 aa  73.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4337  peptidase M20  27.54 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  30.62 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>