More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7949 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 371 aa  746    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  63.49 
 
 		 354 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.76 
 
 		 354 aa  421  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.09 
 
 		 353 aa  418  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.52 
 
 		 359 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.72 
 
 		 374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.79 
 
 		 367 aa  403  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.29 
 
 		 351 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  59.73 
 
 		 353 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.54 
 
 		 357 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.58 
 
 		 354 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.32 
 
 		 378 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.42 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.45 
 
 		 371 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.05 
 
 		 371 aa  381  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.21 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.86 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.86 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.6 
 
 		 378 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.86 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.44 
 
 		 354 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.88 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.45 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.34 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.73 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.17 
 
 		 359 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.35 
 
 		 358 aa  365  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.53 
 
 		 397 aa  363  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.73 
 
 		 394 aa  362  7.0000000000000005e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.1 
 
 		 359 aa  352  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.16 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.37 
 
 		 370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.86 
 
 		 378 aa  342  8e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.09 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.69 
 
 		 376 aa  339  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.04 
 
 		 401 aa  300  4e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.54 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.05 
 
 		 361 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.94 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.66 
 
 		 368 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.1 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  38.57 
 
 		 344 aa  190  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.33 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  37.34 
 
 		 368 aa  182  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  27.78 
 
 		 362 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  29.66 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  31.2 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  27.34 
 
 		 365 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  25.47 
 
 		 420 aa  90.9  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  28.85 
 
 		 368 aa  90.5  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.25 
 
 		 400 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.25 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.21 
 
 		 398 aa  87  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  29.74 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.82 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.69 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  23.45 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  27.05 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  31.91 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1814  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.74 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.29 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  30.6 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  27.95 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  29.88 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  30.4 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  30.09 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  30.79 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.73 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.27 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  31.53 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.89 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.89 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  23.94 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.16 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.41 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  26.44 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  24.27 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1541  peptidase M20  27.89 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  31.49 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.68 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  31.46 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  31.66 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.74 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.1 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  29.6 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  26.91 
 
 		 384 aa  79.3  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.23 
 
 		 391 aa  79.3  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  28.95 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  27.11 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  28.66 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.05 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  24.85 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.9 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  25.08 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  29.23 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4337  peptidase M20  25.82 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  28.04 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.73 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  30.34 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>