More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0171 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  100 
 
 
341 aa  694    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.02 
 
 
396 aa  122  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0377  peptidase M20  28.85 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  29.77 
 
 
378 aa  119  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0275  acetylornithine deacetylase  25.93 
 
 
401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4337  peptidase M20  27.43 
 
 
379 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0989  peptidase M20  27.09 
 
 
371 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.64 
 
 
357 aa  109  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1671  acetylornithine deacetylase  29.22 
 
 
367 aa  105  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.09506  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.86 
 
 
356 aa  99.8  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  26.63 
 
 
368 aa  99.8  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  23.88 
 
 
368 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  25.21 
 
 
373 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.29 
 
 
371 aa  96.7  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.81 
 
 
417 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2692  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.76 
 
 
378 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310505  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.15 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 
358 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  26.81 
 
 
337 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  25.86 
 
 
382 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.88 
 
 
368 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3178  peptidase M20  27.35 
 
 
403 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.42 
 
 
422 aa  90.5  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  23.76 
 
 
399 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.06 
 
 
357 aa  90.1  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.88 
 
 
368 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  31.49 
 
 
400 aa  90.1  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.05 
 
 
387 aa  89.7  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.16 
 
 
368 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.96 
 
 
376 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  26.76 
 
 
401 aa  88.6  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1085  peptidase M20  26.86 
 
 
403 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000939958 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.39 
 
 
375 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2318  peptidase M20  28.44 
 
 
449 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00838569  decreased coverage  0.00000161577 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.37 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.94 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.82 
 
 
389 aa  87  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.26 
 
 
357 aa  86.3  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.68 
 
 
370 aa  86.3  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.93 
 
 
378 aa  86.3  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.29 
 
 
354 aa  86.3  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.64 
 
 
359 aa  86.3  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  23.1 
 
 
389 aa  85.9  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1861  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  25.68 
 
 
335 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.01 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28027  predicted protein  26.7 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  24.86 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.21 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.99 
 
 
354 aa  84  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3165  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.78 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.608359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.05 
 
 
424 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.35 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.23 
 
 
371 aa  82.8  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  23.9 
 
 
402 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.07 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  22.19 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.94 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  22.69 
 
 
753 aa  80.5  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.71 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.15 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2738  peptidase M20  24.91 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.74 
 
 
433 aa  79.7  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.58 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  23.51 
 
 
424 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.38 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  24.66 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0810  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  22.99 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.18 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  24.23 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.1 
 
 
397 aa  77  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  27.91 
 
 
365 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3265  acetylornithine deacetylase  26.37 
 
 
416 aa  77  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.366543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3363  acetylornithine deacetylase  26.91 
 
 
375 aa  77  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288283  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.37 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  23 
 
 
391 aa  75.9  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0881  acetylornithine deacetylase  26.81 
 
 
419 aa  75.9  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.477739  normal  0.0291796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0327  Acetylornithine deacetylase/Succinyl- diaminopimelate desuccinylase and related deacylase-like protein  23.21 
 
 
434 aa  75.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  22.89 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4229  peptidase M20  24.92 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2538  peptidase M20  26.32 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561977  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0612  peptidase M20  34.65 
 
 
550 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.46 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.89 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3374  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25.43 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  26.06 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.03 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  25.92 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  23.8 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3755  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.86 
 
 
431 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0601129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.71 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.96 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  25.08 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.2 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.84 
 
 
375 aa  72.8  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  27.74 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  24.93 
 
 
417 aa  72.8  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>