More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28027 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28027  predicted protein  100 
 
 		 401 aa  817    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05749  putative acetylornithine deacetylase (Eurofung)  38.3 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0187608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  34.82 
 
 		 337 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2692  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.2 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310505  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  28.25 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  31.66 
 
 		 382 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.39 
 
 		 405 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  27.44 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4229  peptidase M20  25.63 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  27.3 
 
 		 364 aa  96.3  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.82 
 
 		 396 aa  94  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.74 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  27.91 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  29.3 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  30.6 
 
 		 390 aa  90.1  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1338  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.15 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.21 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3428  peptidase M20  24.79 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00953913  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  27.67 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  31.44 
 
 		 386 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.65 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25.58 
 
 		 422 aa  86.7  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  26.15 
 
 		 392 aa  86.3  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  31.86 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.81 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  28.33 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4337  peptidase M20  35.15 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  29.85 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  27.35 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.54 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  31.88 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  26.7 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  30.08 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25.45 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  26.13 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  23.43 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.24 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  28.51 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  25.21 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  30.24 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  23.43 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0275  acetylornithine deacetylase  34.34 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141091  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  27.76 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  26.74 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  30.87 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2738  peptidase M20  29.71 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  23.7 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0306  peptidase M20  23.33 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.25 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  26.32 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  27.57 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6551  peptidase M20  27.65 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.24 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4431  peptidase dimerisation domain protein  24.12 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0204618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  27.08 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  27.3 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  28.88 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  27.08 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.08 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  27.08 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  26.76 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  24.43 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  25.08 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  27.08 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  27.08 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  26.76 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  26.76 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.34 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  29.74 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  29.74 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  27.08 
 
 		 383 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  24.92 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  26.54 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  28.35 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  25.13 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0474  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.8 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  26.79 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  27.09 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  26.46 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  27.92 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.8 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  26.74 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0095  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.76 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  29.39 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.8 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.99 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.52 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  27 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  28.87 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  27.16 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  27.5 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  26.74 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  25.22 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  24.21 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>