More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0306 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0306  peptidase M20  100 
 
 		 360 aa  748    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4431  peptidase dimerisation domain protein  73.35 
 
 		 361 aa  554  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0204618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  65.24 
 
 		 360 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6551  peptidase M20  63.61 
 
 		 354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3087  acetylornithine deacetylase  61.89 
 
 		 354 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3428  peptidase M20  58.55 
 
 		 356 aa  432  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00953913  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  40.46 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  27.53 
 
 		 387 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  26.99 
 
 		 387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  27.69 
 
 		 391 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  27.7 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.39 
 
 		 402 aa  112  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  25.94 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  28.05 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  26.99 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  27.08 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  29.21 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  29.97 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  26.17 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  26.42 
 
 		 390 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  27.51 
 
 		 388 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  26.4 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  29.21 
 
 		 416 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  28.42 
 
 		 380 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  27.03 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  25.71 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  27.49 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  26.67 
 
 		 384 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.25 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  26.61 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  25.6 
 
 		 384 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  26.46 
 
 		 380 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  27.45 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  27.09 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  27.47 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  28.85 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  24.32 
 
 		 392 aa  93.2  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  28.65 
 
 		 374 aa  92.8  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.16 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.94 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  26.55 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.7 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  26.92 
 
 		 376 aa  89.7  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  24.22 
 
 		 386 aa  89.7  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.19 
 
 		 354 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  26.06 
 
 		 413 aa  88.6  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  31.63 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  25.95 
 
 		 383 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  25.46 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  24.4 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  27.91 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  24.77 
 
 		 422 aa  87  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  25.06 
 
 		 387 aa  87  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  27.24 
 
 		 411 aa  87  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.15 
 
 		 398 aa  87  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  26.71 
 
 		 398 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  24.18 
 
 		 384 aa  86.3  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  25.27 
 
 		 401 aa  85.9  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  28.62 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  25.63 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  28.62 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.68 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.34 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  27.62 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  27 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  28.62 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  23.86 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  28.62 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  28.84 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  24.86 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.19 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.33 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  28.62 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  28.62 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.66 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.09 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.97 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  28.62 
 
 		 586 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  27.95 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  27.23 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.25 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.25 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  27.95 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  27.95 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.25 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.53 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  27.45 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3693  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.53 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02363  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.53 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1198  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.53 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2618  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.53 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2602  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.53 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2751  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.53 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  26.12 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1205  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.53 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.270871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02325  hypothetical protein  25.53 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  25.98 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  27.21 
 
 		 416 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.45 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  27.1 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>