More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3087 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3087  acetylornithine deacetylase  100 
 
 		 354 aa  728    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  64 
 
 		 360 aa  485  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4431  peptidase dimerisation domain protein  66.38 
 
 		 361 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0204618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6551  peptidase M20  60.97 
 
 		 354 aa  454  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0306  peptidase M20  61.89 
 
 		 360 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3428  peptidase M20  55.59 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00953913  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  36.83 
 
 		 368 aa  230  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.8 
 
 		 442 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.49 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  27.39 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  26.94 
 
 		 398 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  29.89 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.6 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.95 
 
 		 417 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  25.88 
 
 		 389 aa  95.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.84 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  27.27 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  27.05 
 
 		 412 aa  94  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  24.69 
 
 		 394 aa  92.8  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.65 
 
 		 398 aa  92.4  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1139  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  29.11 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0335688  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.84 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  26.22 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  27.27 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.53 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  24.68 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  26.29 
 
 		 390 aa  90.1  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  24.72 
 
 		 411 aa  90.1  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  27.9 
 
 		 419 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.9 
 
 		 413 aa  89.7  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  27.34 
 
 		 389 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  27.34 
 
 		 389 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  27.34 
 
 		 405 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  27.34 
 
 		 405 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  27.34 
 
 		 405 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  27.34 
 
 		 405 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  28.27 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  26.19 
 
 		 416 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.78 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  27.49 
 
 		 586 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  24.23 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  22.76 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.82 
 
 		 387 aa  87.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  27.74 
 
 		 404 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.15 
 
 		 400 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.06 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.36 
 
 		 400 aa  85.9  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  26.23 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  28.66 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.11 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  28.66 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  25.54 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  25.19 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  26.63 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3116  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.43 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.210379  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  27.03 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  26.05 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  25.96 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  26.22 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  28.35 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  28.35 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.89 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  26.45 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2738  peptidase M20  27.62 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  24.8 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  28.91 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  26.37 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  25.19 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4537  peptidase  23.82 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.468696  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  24.46 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  28.04 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.57 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.42 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2961  peptidase  27.17 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  28.91 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  26.52 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  28.91 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.14 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  28.91 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  29.09 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.09 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  26.45 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.72 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  29.09 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  24.25 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.99 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  28.26 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.65 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.47 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.3 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  26.22 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  28.39 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.94 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  27.1 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.94 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.06 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.72 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.16 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>