More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4203 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  100 
 
 		 360 aa  745    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4431  peptidase dimerisation domain protein  65.71 
 
 		 361 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0204618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3087  acetylornithine deacetylase  64 
 
 		 354 aa  485  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6551  peptidase M20  62.99 
 
 		 354 aa  474  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0306  peptidase M20  65.24 
 
 		 360 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3428  peptidase M20  58.67 
 
 		 356 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00953913  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  36.62 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  27.78 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  26.3 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.42 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  25.34 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.69 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  29.41 
 
 		 416 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.69 
 
 		 442 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.25 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  27.02 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.18 
 
 		 357 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.94 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  28.03 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.37 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  25.54 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  25.33 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.53 
 
 		 424 aa  93.2  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  26.34 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  24.32 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  25.47 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.56 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  24.44 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  25.41 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  23.97 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4229  peptidase M20  25.38 
 
 		 397 aa  90.5  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.58 
 
 		 398 aa  89.7  7e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  25.47 
 
 		 384 aa  89.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1267  peptidase  26.79 
 
 		 394 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.51 
 
 		 387 aa  89.4  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  24.93 
 
 		 387 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.45 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  25.57 
 
 		 399 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  27.46 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  27.45 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  28.35 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.61 
 
 		 398 aa  88.6  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.69 
 
 		 358 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3116  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.87 
 
 		 395 aa  87.4  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.210379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2738  peptidase M20  28.57 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  25.55 
 
 		 391 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  24.41 
 
 		 382 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  25.75 
 
 		 387 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.91 
 
 		 357 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1579  acetylornithine deacetylase  25.2 
 
 		 387 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.669783 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  24.16 
 
 		 388 aa  85.9  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.25 
 
 		 381 aa  85.9  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  23.53 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.31 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  25.45 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.77 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1139  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.87 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0335688  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.47 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  23.08 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  28.39 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0449  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.53 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.408478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1338  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.67 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.48 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  24.32 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  25.48 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.2 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.56 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  27.21 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1531  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.47 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.27 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  31.27 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3336  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.19 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0627884 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  24.93 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.52 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  26.54 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  25.9 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.65 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.35 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2538  peptidase M20  25.31 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.98 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  24.86 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.84 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3149  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.87 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0080  peptidase M20  27.96 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.306901  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.54 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  27.81 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.48 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.48 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  24.2 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  27.36 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  24.4 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1880  acetylornithine deacetylase  25.07 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  23.28 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.14 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  25.61 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  26.77 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  26.72 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  25.89 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>