More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0424 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  100 
 
 		 413 aa  856    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1729  peptidase  68.67 
 
 		 400 aa  587  1e-166  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02705  hypothetical protein  70.54 
 
 		 403 aa  577  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0820  M20/DapE family protein YgeY  70.54 
 
 		 403 aa  577  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4162  peptidase  70.54 
 
 		 403 aa  577  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0836  peptidase  70.54 
 
 		 403 aa  577  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02667  hypothetical protein  70.54 
 
 		 402 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3005  peptidase  70.54 
 
 		 403 aa  577  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3197  peptidase  70.8 
 
 		 403 aa  578  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3032  peptidase  70.54 
 
 		 403 aa  577  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2652  M20/DapE family protein YgeY  63.43 
 
 		 443 aa  570  1e-161  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1663  M20/DapE family protein YgeY  62.07 
 
 		 436 aa  549  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0240  peptidase  58.94 
 
 		 460 aa  522  1e-147  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000787577  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1432  peptidase  58.62 
 
 		 445 aa  511  1e-144  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  49.35 
 
 		 401 aa  411  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  44.84 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  34.87 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  31.69 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0260  peptidase  31.74 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  30.13 
 
 		 402 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1267  peptidase  33.68 
 
 		 394 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2961  peptidase  30.48 
 
 		 395 aa  159  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4537  peptidase  30.89 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.468696  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.56 
 
 		 410 aa  131  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  33.13 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.57 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.05 
 
 		 431 aa  99.8  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.1 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.9 
 
 		 435 aa  97.1  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  22.59 
 
 		 422 aa  96.3  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.88 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.33 
 
 		 439 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  22.76 
 
 		 422 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  26.67 
 
 		 373 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.06 
 
 		 398 aa  93.6  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.03 
 
 		 423 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 422 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  25.95 
 
 		 422 aa  93.2  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  25.95 
 
 		 364 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  22.76 
 
 		 422 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.75 
 
 		 357 aa  90.9  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  25.38 
 
 		 364 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.6 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.92 
 
 		 395 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  24.78 
 
 		 422 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  24.78 
 
 		 422 aa  90.5  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  24.78 
 
 		 422 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  25.07 
 
 		 422 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  22.28 
 
 		 422 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.61 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.6 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  23.63 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.63 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.11 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.11 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.36 
 
 		 423 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.76 
 
 		 428 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.82 
 
 		 396 aa  88.2  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0306  peptidase M20  25.2 
 
 		 360 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  22.71 
 
 		 422 aa  87  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  23.72 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  23.75 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  26.65 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.34 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  22.98 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.33 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  23.45 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  26.34 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  25.57 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0948  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.26 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.65 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.21 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  23.28 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  26.41 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0918  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.46 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  24.32 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.31 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4431  peptidase dimerisation domain protein  24.76 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0204618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.25 
 
 		 354 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.93 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  25.52 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.52 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  25.52 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  23.41 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  25.52 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  25.52 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  26.11 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.42 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  27.05 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2318  peptidase M20  24.93 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00838569  decreased coverage  0.00000161577 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  24.81 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  23.5 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.73 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  25.26 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  25.52 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  24.49 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  25.97 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1991  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.19 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0346  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.95 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0940118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>