More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2652 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2652  M20/DapE family protein YgeY  100 
 
 
443 aa  914    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1432  peptidase  72.5 
 
 
445 aa  659    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1663  M20/DapE family protein YgeY  82.68 
 
 
436 aa  748    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0240  peptidase  67.51 
 
 
460 aa  603  1.0000000000000001e-171  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000787577  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  63.43 
 
 
413 aa  570  1e-161  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3197  peptidase  63.22 
 
 
403 aa  565  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02705  hypothetical protein  62.99 
 
 
403 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0820  M20/DapE family protein YgeY  62.99 
 
 
403 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3032  peptidase  62.99 
 
 
403 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02667  hypothetical protein  63.13 
 
 
402 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0836  peptidase  62.99 
 
 
403 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3005  peptidase  62.99 
 
 
403 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4162  peptidase  62.99 
 
 
403 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1729  peptidase  59.49 
 
 
400 aa  537  1e-151  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  45.75 
 
 
401 aa  364  2e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  41.15 
 
 
401 aa  331  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  29.33 
 
 
394 aa  176  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0260  peptidase  30.58 
 
 
394 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  29.15 
 
 
394 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1267  peptidase  28.1 
 
 
394 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  26.68 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4537  peptidase  27.36 
 
 
386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.468696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2961  peptidase  27.4 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.97 
 
 
410 aa  110  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  24.41 
 
 
422 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  23.39 
 
 
422 aa  94.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  24.32 
 
 
393 aa  92.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  24.79 
 
 
422 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  24.41 
 
 
422 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  23.35 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  24.2 
 
 
422 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  23 
 
 
422 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  24.2 
 
 
422 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  24.2 
 
 
422 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  24.2 
 
 
422 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  24.2 
 
 
422 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  22.52 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.46 
 
 
405 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.24 
 
 
385 aa  86.7  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  25.96 
 
 
411 aa  86.3  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.71 
 
 
428 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.86 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.09 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.09 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.25 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 
383 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 
383 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  25.25 
 
 
383 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.64 
 
 
414 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 
383 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  25 
 
 
383 aa  82  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.94 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  25 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.15 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  23.13 
 
 
446 aa  79.7  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.96 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  22.54 
 
 
368 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  23.04 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  24.75 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  34.01 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4431  peptidase dimerisation domain protein  26.81 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0204618  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.06 
 
 
431 aa  76.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  24.04 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.64 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  31.05 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  23.61 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  24.04 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.47 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.56 
 
 
433 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0306  peptidase M20  24.32 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  29.23 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  30.96 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  29.23 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.87 
 
 
435 aa  73.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  24.7 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  23.15 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  26.19 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  28.51 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.93 
 
 
377 aa  72.8  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4015  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  22.27 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  24.22 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  30.58 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  21.56 
 
 
388 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  27.68 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  22.25 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  23.8 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0025  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.14 
 
 
429 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.42 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.23 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0467  acetylornithine deacetylase  22.48 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0406  acetylornithine deacetylase  21.94 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0493  acetylornithine deacetylase  22.48 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.13 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>