More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1729 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1729  peptidase  100 
 
 		 400 aa  832    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3197  peptidase  71.03 
 
 		 403 aa  594  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02705  hypothetical protein  70.77 
 
 		 403 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0820  M20/DapE family protein YgeY  70.77 
 
 		 403 aa  593  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3032  peptidase  70.77 
 
 		 403 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0836  peptidase  70.77 
 
 		 403 aa  593  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3005  peptidase  70.77 
 
 		 403 aa  593  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4162  peptidase  70.77 
 
 		 403 aa  593  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02667  hypothetical protein  70.77 
 
 		 402 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  68.67 
 
 		 413 aa  587  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1663  M20/DapE family protein YgeY  59.4 
 
 		 436 aa  538  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2652  M20/DapE family protein YgeY  59.49 
 
 		 443 aa  537  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1432  peptidase  56.98 
 
 		 445 aa  504  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0240  peptidase  53.79 
 
 		 460 aa  473  1e-132  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000787577  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  54.34 
 
 		 401 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  47.84 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  34.09 
 
 		 394 aa  202  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4537  peptidase  31.13 
 
 		 386 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.468696  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1267  peptidase  31.31 
 
 		 394 aa  170  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  30.46 
 
 		 394 aa  169  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0260  peptidase  31.65 
 
 		 394 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  30.6 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2961  peptidase  32.07 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.55 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  24.42 
 
 		 422 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.87 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  28.88 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  24.36 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  23.65 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  23.09 
 
 		 422 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  23.53 
 
 		 422 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  23.53 
 
 		 422 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  23.53 
 
 		 422 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  23.53 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.54 
 
 		 435 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.14 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  23.09 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  22.74 
 
 		 422 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.18 
 
 		 407 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.18 
 
 		 407 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2048  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 418 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  22.35 
 
 		 422 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.68 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.44 
 
 		 428 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.95 
 
 		 433 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.85 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.84 
 
 		 428 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  26.19 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  25.86 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4337  peptidase M20  26.37 
 
 		 379 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  22.25 
 
 		 424 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  25.2 
 
 		 383 aa  90.5  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  25.33 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  26.06 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  25.33 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.33 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  25.33 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  26.06 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  25.33 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  26.06 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  26.06 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  26.06 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  25.33 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  24.93 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  25.31 
 
 		 373 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  23.67 
 
 		 355 aa  87.4  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0918  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.29 
 
 		 377 aa  86.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  25.27 
 
 		 383 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0948  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.82 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.37 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.46 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.61 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  24.66 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.71 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  24.8 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0497  acetylornithine deacetylase  21.97 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00375868  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.22 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  23.22 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0410  acetylornithine deacetylase  21.72 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0475  acetylornithine deacetylase  21.97 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.91 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  26.13 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.65 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.93 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.64 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0548  acetylornithine deacetylase  23.25 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000707223  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  24.59 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  21.08 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.17 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0406  acetylornithine deacetylase  22.36 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  25.94 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0467  acetylornithine deacetylase  23 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0493  acetylornithine deacetylase  23 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.81 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  25.26 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  25.26 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  24.75 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  25.26 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  25.56 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>