More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0027 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  100 
 
 		 355 aa  723    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0347  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  77.65 
 
 		 366 aa  556  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1391  acetyl-lysine deacetylase  54.42 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.971431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3459  acetyl-lysine deacetylase  49.57 
 
 		 352 aa  296  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2723  acetyl-lysine deacetylase  47.18 
 
 		 366 aa  285  7e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2180  acetyl-lysine deacetylase  43.35 
 
 		 348 aa  277  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.749889 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0317  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  41.19 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3310  acetyl-lysine deacetylase  40.63 
 
 		 351 aa  233  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0776  acetyl-lysine deacetylase  36.93 
 
 		 351 aa  202  6e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.689856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6288  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  39.71 
 
 		 361 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1498  acetyl-lysine deacetylase  36.62 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0324  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  36.57 
 
 		 356 aa  179  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2612  acetyl-lysine deacetylase  35.04 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.880671  normal  0.701984 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0451  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  34.35 
 
 		 346 aa  169  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1757  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  34.52 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  29.91 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0867  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31.64 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  32.11 
 
 		 335 aa  119  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1861  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  32.11 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0170  acetyl-lysine deacetylase  32.24 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000443828  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1259  acetylornithine deacetylase / N2-acetyl-L-lysine deacetylase  30.11 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  23.39 
 
 		 401 aa  97.4  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1139  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  23.49 
 
 		 346 aa  96.3  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0335688  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.25 
 
 		 359 aa  89.7  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  25.71 
 
 		 401 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1729  peptidase  23.67 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3178  peptidase M20  28.53 
 
 		 403 aa  87  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.44 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.41 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.41 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.41 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.37 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  24.67 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  29.17 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  24.32 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.09 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1085  peptidase M20  28.01 
 
 		 403 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000939958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.93 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1663  M20/DapE family protein YgeY  30.05 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.12 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.3 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1267  peptidase  24.36 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.55 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.11 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.08 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4337  peptidase M20  27.53 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  24.87 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  26.44 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4537  peptidase  25.26 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.468696  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0240  peptidase  29.77 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000787577  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2652  M20/DapE family protein YgeY  28.64 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1432  peptidase  29.52 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  25.56 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  26.04 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.07 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3197  peptidase  29.89 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.36 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.2 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3005  peptidase  29.35 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02705  hypothetical protein  29.35 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0820  M20/DapE family protein YgeY  29.35 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02667  hypothetical protein  28.88 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3032  peptidase  29.35 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0260  peptidase  23.66 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.9 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4162  peptidase  29.35 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0836  peptidase  29.35 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.72 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  20.88 
 
 		 413 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.74 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  25.71 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.71 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.55 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  25.71 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  25.71 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  25.71 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  25.71 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  27.52 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  28.61 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  25.45 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.44 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.25 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  25.45 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.85 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.52 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2019  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.57 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  26.74 
 
 		 381 aa  67  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  25.14 
 
 		 337 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 424 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.95 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  26.17 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.86 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  22.44 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  20.21 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  24.1 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  27.96 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  26.15 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  28.75 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  26.04 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>