More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0874 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 376 aa  737    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  75.27 
 
 		 359 aa  518  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  66.39 
 
 		 356 aa  434  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.98 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.68 
 
 		 354 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.22 
 
 		 366 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.76 
 
 		 367 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.22 
 
 		 366 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.32 
 
 		 358 aa  401  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.22 
 
 		 366 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  61.26 
 
 		 354 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.18 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.34 
 
 		 354 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.38 
 
 		 351 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.03 
 
 		 353 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.49 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.1 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.83 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.37 
 
 		 375 aa  376  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.62 
 
 		 359 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.66 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  57.34 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.3 
 
 		 374 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.67 
 
 		 378 aa  362  4e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.05 
 
 		 359 aa  361  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.91 
 
 		 354 aa  355  6.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.73 
 
 		 371 aa  353  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56 
 
 		 358 aa  352  8e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.66 
 
 		 378 aa  348  9e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.19 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.3 
 
 		 370 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.94 
 
 		 364 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.41 
 
 		 371 aa  330  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.78 
 
 		 397 aa  330  4e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.27 
 
 		 378 aa  329  4e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.73 
 
 		 401 aa  309  5e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.77 
 
 		 356 aa  213  5.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.12 
 
 		 354 aa  210  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  37.5 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.92 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.46 
 
 		 361 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.11 
 
 		 368 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.01 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  39.18 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  31.62 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  29.79 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  29.78 
 
 		 365 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  29.34 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  32.08 
 
 		 368 aa  96.3  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  29.12 
 
 		 376 aa  93.6  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.88 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  30.79 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.27 
 
 		 388 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3480  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.62 
 
 		 404 aa  89.7  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.4 
 
 		 400 aa  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.78 
 
 		 392 aa  89.7  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  23.96 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  28.82 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  25.5 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  28.83 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.43 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  31.21 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  29.13 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.61 
 
 		 393 aa  87  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  28.82 
 
 		 416 aa  87  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.09 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.67 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  27.84 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  26.24 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  28.27 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  26.32 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.73 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  27.34 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1267  peptidase  25.9 
 
 		 394 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  23.68 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  27.54 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  27 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  27.54 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  27.54 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1541  peptidase M20  29.01 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0781  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.61 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.946099  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.61 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.438306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.3 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.89 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.69 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  29.52 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  30.29 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1291  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.51 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.64 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  28.06 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  27.76 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  26.79 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.96 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  26.57 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0347  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.93 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  26.65 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  26.49 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  29.91 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  29.34 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>