More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4242 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
366 aa  727    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
366 aa  727    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
366 aa  727    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  86.89 
 
 
354 aa  598  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  85.47 
 
 
354 aa  590  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  80.63 
 
 
354 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  70.49 
 
 
369 aa  508  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  71.55 
 
 
364 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  64.36 
 
 
367 aa  458  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  63.28 
 
 
359 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  64.15 
 
 
358 aa  428  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.81 
 
 
358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  63.69 
 
 
359 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.06 
 
 
354 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.88 
 
 
376 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.5 
 
 
375 aa  392  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.5 
 
 
356 aa  391  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.64 
 
 
354 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.7 
 
 
357 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.11 
 
 
357 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.86 
 
 
371 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.3 
 
 
371 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.4 
 
 
354 aa  378  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.02 
 
 
370 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.51 
 
 
353 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.27 
 
 
359 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.73 
 
 
374 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  56.43 
 
 
353 aa  347  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.39 
 
 
351 aa  344  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.87 
 
 
397 aa  338  7e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.16 
 
 
378 aa  333  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.65 
 
 
394 aa  332  6e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.99 
 
 
371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50 
 
 
378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.37 
 
 
378 aa  316  5e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.75 
 
 
401 aa  281  9e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.52 
 
 
356 aa  211  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  39.44 
 
 
344 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.46 
 
 
368 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.9 
 
 
368 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.6 
 
 
354 aa  189  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.12 
 
 
361 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.62 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  34.77 
 
 
368 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  30.03 
 
 
365 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  29.58 
 
 
368 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  29.81 
 
 
404 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  31.71 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3428  peptidase M20  26.11 
 
 
356 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00953913  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.19 
 
 
375 aa  90.9  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  31.78 
 
 
385 aa  90.5  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  29.76 
 
 
373 aa  90.9  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  30.94 
 
 
375 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  29.53 
 
 
377 aa  89.4  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2717  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.56 
 
 
391 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  29.41 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.04 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3480  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.04 
 
 
404 aa  86.7  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.99 
 
 
391 aa  86.7  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.78 
 
 
391 aa  86.7  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  26.55 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.51 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2469  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.89 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000634543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2473  peptidase M20  29.6 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  32.44 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  27.22 
 
 
403 aa  82.8  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  25.19 
 
 
394 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1668  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.89 
 
 
401 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0474135 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.55 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.27 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.35 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  27.57 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.37 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.37 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0275  acetylornithine deacetylase  28.76 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141091  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.45 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.53 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1085  peptidase M20  26.8 
 
 
403 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000939958 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  31.85 
 
 
374 aa  79.3  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.81 
 
 
393 aa  79.3  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0642  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.54 
 
 
402 aa  79.3  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.39661  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1390  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.41 
 
 
386 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3087  acetylornithine deacetylase  25.41 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.84 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3178  peptidase M20  27.1 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  30.57 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.82 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.467708  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.73 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.44 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.38 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1804  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.85 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0689482  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  26.85 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3241  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.71 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1343  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.71 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2596  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.71 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2071  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.71 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.65 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2451  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.71 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.684558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0306  peptidase M20  27.25 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.11 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>