More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2525 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 378 aa  764    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  86.52 
 
 		 374 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  61.35 
 
 		 359 aa  428  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.27 
 
 		 378 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  61.89 
 
 		 378 aa  410  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.52 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.23 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.02 
 
 		 354 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.78 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.54 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.83 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.32 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.38 
 
 		 371 aa  388  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  57.3 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.85 
 
 		 351 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.34 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.06 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.82 
 
 		 367 aa  368  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.2 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.65 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.1 
 
 		 359 aa  355  5.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.52 
 
 		 359 aa  355  7.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.39 
 
 		 375 aa  349  5e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.22 
 
 		 358 aa  349  6e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.42 
 
 		 370 aa  348  7e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.17 
 
 		 401 aa  339  4e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.29 
 
 		 356 aa  332  6e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.66 
 
 		 376 aa  332  8e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50 
 
 		 354 aa  325  9e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.87 
 
 		 369 aa  324  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.13 
 
 		 366 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.18 
 
 		 354 aa  317  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.13 
 
 		 366 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.13 
 
 		 366 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.46 
 
 		 354 aa  317  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.54 
 
 		 364 aa  298  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.74 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.42 
 
 		 354 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.54 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.64 
 
 		 361 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.26 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.31 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  38.63 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  36.39 
 
 		 368 aa  179  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.6 
 
 		 387 aa  112  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  28.49 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  29.87 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  32.65 
 
 		 378 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.32 
 
 		 388 aa  99.8  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  30.37 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  27.65 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  32.1 
 
 		 428 aa  97.1  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.96 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  26.23 
 
 		 412 aa  94  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.84 
 
 		 400 aa  93.6  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  26.65 
 
 		 420 aa  93.2  8e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  30.37 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  31.4 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  29.62 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  30.08 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  29.94 
 
 		 374 aa  90.1  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  28.61 
 
 		 384 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  28.7 
 
 		 384 aa  90.1  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  26.23 
 
 		 416 aa  89.7  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.62 
 
 		 407 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  29.74 
 
 		 376 aa  89.4  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.25 
 
 		 396 aa  89.4  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.62 
 
 		 407 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  30.79 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  30.42 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.71 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  29.85 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.76 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  26.98 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1994  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.27 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  27.75 
 
 		 403 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  28.34 
 
 		 385 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  27.96 
 
 		 419 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.74 
 
 		 400 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.94 
 
 		 398 aa  86.3  9e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12180  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  29.41 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0246803  normal  0.255441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  28.31 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.22 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.81 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  28.86 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1291  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.23 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  27.76 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  30.66 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  28.23 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  28.23 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  28.23 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  28.23 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.48 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  28.06 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  28.23 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  30.09 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.53 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  28.23 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3374  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.03 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  28.42 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>