More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3969 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
368 aa  724    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  98.37 
 
 
368 aa  716    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  98.64 
 
 
368 aa  717    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  77.47 
 
 
361 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  53.35 
 
 
368 aa  333  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.82 
 
 
356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.4 
 
 
354 aa  259  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.27 
 
 
378 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.86 
 
 
356 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.39 
 
 
353 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.76 
 
 
367 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.84 
 
 
357 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.71 
 
 
375 aa  203  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.66 
 
 
354 aa  202  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.46 
 
 
371 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.69 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.02 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.34 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.43 
 
 
354 aa  199  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.99 
 
 
358 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.79 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.53 
 
 
354 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.18 
 
 
359 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.1 
 
 
376 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.83 
 
 
371 aa  195  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.57 
 
 
351 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.92 
 
 
378 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.74 
 
 
370 aa  191  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.44 
 
 
354 aa  189  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.45 
 
 
371 aa  189  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.5 
 
 
401 aa  189  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.67 
 
 
359 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.9 
 
 
366 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.9 
 
 
366 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.9 
 
 
366 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.61 
 
 
354 aa  186  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40 
 
 
397 aa  186  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  38.62 
 
 
353 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.01 
 
 
354 aa  182  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.55 
 
 
369 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.27 
 
 
358 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.52 
 
 
394 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.46 
 
 
364 aa  155  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  38.1 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  35.41 
 
 
378 aa  123  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  30 
 
 
362 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  30 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  32.39 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 
400 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  29.37 
 
 
364 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.95 
 
 
387 aa  93.2  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  33.55 
 
 
394 aa  93.2  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  29.62 
 
 
400 aa  92.8  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  27.39 
 
 
412 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  23.12 
 
 
341 aa  92  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  30 
 
 
374 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.22 
 
 
391 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  26.26 
 
 
404 aa  90.1  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.79 
 
 
402 aa  89.7  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.02 
 
 
391 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.79 
 
 
393 aa  89.7  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  31.15 
 
 
411 aa  89.4  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.61 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  29.18 
 
 
368 aa  87.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  28.04 
 
 
416 aa  87  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  22.87 
 
 
381 aa  86.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  29.75 
 
 
385 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  29.92 
 
 
410 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.18 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.59 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  30.56 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.73 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.3 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.08 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  30.4 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  27.79 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.96 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.16 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  31.97 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  27.35 
 
 
393 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  31.19 
 
 
374 aa  82  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  24.78 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  30.66 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.12 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.94 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1862  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.65 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000241136 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  25.43 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  30.91 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  26.63 
 
 
753 aa  80.1  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.33 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  30.66 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1814  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.66 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93447  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3363  acetylornithine deacetylase  35.05 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  24.31 
 
 
383 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  30.38 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  24.43 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  31.06 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.16 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  28 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  28.66 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>