More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3363 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3363  acetylornithine deacetylase  100 
 
 		 375 aa  722    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288283  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  32.2 
 
 		 393 aa  139  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  31.88 
 
 		 753 aa  136  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  28.61 
 
 		 412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  30.12 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.08 
 
 		 402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  33.33 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  34.1 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  26.29 
 
 		 404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  32.25 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  33.25 
 
 		 376 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  33.07 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  27.51 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  30.11 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  26.95 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  33.44 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.34 
 
 		 396 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  28.66 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  34.64 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  30.39 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  32.82 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  30.19 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  32.6 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  28.86 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  28.86 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  28.86 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  28.86 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  28.86 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  28.86 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  23.5 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  29.47 
 
 		 405 aa  99.8  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  28.86 
 
 		 586 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  29.82 
 
 		 411 aa  99.4  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  28.72 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  30.1 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  31.97 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  27.55 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  29.25 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  30.72 
 
 		 416 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  31.91 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.46 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  30.21 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  30.21 
 
 		 386 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.54 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.53 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.53 
 
 		 391 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5029  acetylornithine deacetylase  33.51 
 
 		 373 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  30.71 
 
 		 424 aa  96.7  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  30.06 
 
 		 404 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  29.63 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.16 
 
 		 429 aa  96.7  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  29 
 
 		 386 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  29.95 
 
 		 385 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  29.67 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  28.31 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  30.5 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  27.99 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  29.25 
 
 		 404 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.22 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  28.62 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.26 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.08 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.98 
 
 		 395 aa  94  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  28.31 
 
 		 406 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  27.81 
 
 		 406 aa  93.2  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.56 
 
 		 398 aa  92.8  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.46 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.97 
 
 		 393 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  31.35 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  28.07 
 
 		 406 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.4 
 
 		 368 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  28.07 
 
 		 406 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  29.08 
 
 		 390 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.21 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4337  peptidase M20  34.26 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  33.42 
 
 		 373 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  28.19 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  28.74 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2938  acetylornithine deacetylase  29.34 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3865  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.84 
 
 		 433 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.838236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.55 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  29.79 
 
 		 426 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  33.86 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.05 
 
 		 368 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.57 
 
 		 413 aa  90.5  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4015  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  31.78 
 
 		 413 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2582  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.48 
 
 		 397 aa  89.7  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2475  acetylornithine deacetylase  32.14 
 
 		 420 aa  89.7  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0713768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  29.62 
 
 		 385 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  25.84 
 
 		 390 aa  89.7  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  28.03 
 
 		 378 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  28.09 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  28.8 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  36.07 
 
 		 434 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.23 
 
 		 433 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.32 
 
 		 423 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  29 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  26.21 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.36 
 
 		 368 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>