More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3942 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
361 aa  716    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  77.46 
 
 
368 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  76.62 
 
 
368 aa  531  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  76.62 
 
 
368 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  51.28 
 
 
368 aa  310  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.68 
 
 
356 aa  288  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.82 
 
 
354 aa  249  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.95 
 
 
367 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.57 
 
 
358 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.31 
 
 
356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.34 
 
 
375 aa  210  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.87 
 
 
359 aa  210  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.05 
 
 
371 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.79 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.44 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.63 
 
 
354 aa  200  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.45 
 
 
378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.83 
 
 
357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  41.26 
 
 
353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.89 
 
 
353 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.46 
 
 
376 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.5 
 
 
374 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.64 
 
 
378 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.5 
 
 
351 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.58 
 
 
369 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.1 
 
 
371 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.89 
 
 
378 aa  186  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.19 
 
 
371 aa  186  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40 
 
 
394 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.12 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.12 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.12 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.25 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.9 
 
 
359 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.87 
 
 
354 aa  183  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.11 
 
 
354 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.61 
 
 
359 aa  182  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.1 
 
 
370 aa  180  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.88 
 
 
401 aa  179  8e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.94 
 
 
397 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.25 
 
 
358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.26 
 
 
364 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  37.96 
 
 
344 aa  138  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  32.93 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  33.99 
 
 
376 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.81 
 
 
393 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.81 
 
 
400 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.49 
 
 
413 aa  99  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  29.21 
 
 
362 aa  97.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.4 
 
 
391 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.72 
 
 
391 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  30.94 
 
 
380 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  32.2 
 
 
373 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  28.69 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  35.83 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.44 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  25.73 
 
 
404 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  32.42 
 
 
400 aa  90.5  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.59 
 
 
402 aa  90.1  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.71 
 
 
391 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.64 
 
 
387 aa  90.1  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  29.58 
 
 
369 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.34 
 
 
392 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  29.33 
 
 
364 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  30.23 
 
 
385 aa  86.7  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3363  acetylornithine deacetylase  41.54 
 
 
375 aa  86.7  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288283  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  32.22 
 
 
410 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  30.29 
 
 
368 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  27.81 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3480  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.21 
 
 
404 aa  84  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.95 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  24.59 
 
 
417 aa  84  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.12 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1862  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.62 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000241136 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  30.07 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.46 
 
 
395 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.77 
 
 
380 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.45 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.03 
 
 
377 aa  82  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0972  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.46 
 
 
395 aa  82  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1647  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.04 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  27.18 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.78 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.66 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.06 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.93 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.93 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1814  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.94 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93447  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  27.96 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  29.19 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  29.6 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.21 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2717  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.19 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  23.71 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0095  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.18 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  23.76 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1765  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.73 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.803337  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  31.37 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  26.04 
 
 
419 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>