More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3899 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
354 aa  704    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  73.37 
 
 
354 aa  526  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  74.57 
 
 
353 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  71.63 
 
 
353 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  65.71 
 
 
351 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.68 
 
 
354 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  63.49 
 
 
371 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  63.03 
 
 
359 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.54 
 
 
371 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.97 
 
 
367 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.78 
 
 
356 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.08 
 
 
374 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.06 
 
 
358 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.7 
 
 
357 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.73 
 
 
357 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.08 
 
 
359 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.6 
 
 
375 aa  392  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.68 
 
 
376 aa  388  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.83 
 
 
378 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.57 
 
 
359 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  61.05 
 
 
378 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.55 
 
 
358 aa  378  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.34 
 
 
397 aa  378  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.15 
 
 
354 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.64 
 
 
366 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.91 
 
 
394 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.75 
 
 
354 aa  374  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.64 
 
 
366 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.06 
 
 
354 aa  378  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.64 
 
 
366 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.16 
 
 
371 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.77 
 
 
369 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58 
 
 
370 aa  359  5e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.03 
 
 
378 aa  347  1e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.08 
 
 
364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.81 
 
 
401 aa  311  7.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.34 
 
 
356 aa  223  6e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  42.12 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.71 
 
 
354 aa  209  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.44 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.71 
 
 
368 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.41 
 
 
368 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.3 
 
 
368 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  37.07 
 
 
368 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.15 
 
 
387 aa  109  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  25.15 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.29 
 
 
388 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  27.04 
 
 
362 aa  92.8  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  26.02 
 
 
416 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  28.65 
 
 
386 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.96 
 
 
413 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.49 
 
 
392 aa  90.5  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  30.45 
 
 
337 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  26.38 
 
 
412 aa  90.1  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  27.95 
 
 
403 aa  89.4  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.97 
 
 
400 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.41 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  30.56 
 
 
378 aa  86.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.94 
 
 
442 aa  86.7  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.16 
 
 
375 aa  86.3  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  24.16 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  27.5 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  26.81 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  32.89 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  26.96 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  28.39 
 
 
379 aa  84  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.4 
 
 
402 aa  84  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  28.26 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  27.5 
 
 
416 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  27.76 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  30.25 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  25.55 
 
 
422 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  30.33 
 
 
374 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  30.64 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  28.9 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  29.14 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  29.82 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  28.02 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  29.09 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  29.32 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  29.43 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  26.3 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  27.82 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  27.27 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.07 
 
 
396 aa  79.3  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  27.33 
 
 
405 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  26.27 
 
 
422 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  27.33 
 
 
389 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  27.33 
 
 
405 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  27.33 
 
 
405 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  27.19 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  27.33 
 
 
405 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  26.56 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  27.33 
 
 
389 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  30 
 
 
387 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  27.33 
 
 
586 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  29.63 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.98 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3470  peptidase M20  30.12 
 
 
424 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.76 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0897692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>