More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_15460 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 378 aa  741    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  61.56 
 
 		 378 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  63.11 
 
 		 374 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.95 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  61.21 
 
 		 378 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.86 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.82 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.64 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.5 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.56 
 
 		 351 aa  363  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.33 
 
 		 353 aa  361  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.56 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.37 
 
 		 371 aa  359  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.04 
 
 		 369 aa  352  5.9999999999999994e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  54.95 
 
 		 353 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.13 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.32 
 
 		 370 aa  347  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.1 
 
 		 367 aa  342  9e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.64 
 
 		 354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.15 
 
 		 356 aa  335  5.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.09 
 
 		 354 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.72 
 
 		 358 aa  333  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.5 
 
 		 357 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50 
 
 		 401 aa  332  6e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.49 
 
 		 376 aa  331  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.95 
 
 		 357 aa  328  7e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.22 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.29 
 
 		 359 aa  324  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.1 
 
 		 359 aa  319  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.43 
 
 		 358 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.52 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.52 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.52 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.41 
 
 		 354 aa  317  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.73 
 
 		 375 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.91 
 
 		 364 aa  306  3e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.4 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.73 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.63 
 
 		 368 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.06 
 
 		 368 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  37.37 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.77 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.89 
 
 		 361 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  41.94 
 
 		 344 aa  186  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.48 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.93 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  29.59 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.22 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  31.79 
 
 		 362 aa  93.2  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  30.61 
 
 		 369 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  25.82 
 
 		 341 aa  89.4  9e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  29.04 
 
 		 337 aa  89.4  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  26.33 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  29.87 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  27.63 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  27.53 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  31.01 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  28.1 
 
 		 398 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.4 
 
 		 385 aa  86.7  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.79 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.42 
 
 		 383 aa  86.3  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.03 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.43 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  27.53 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.46 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  29.58 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  30 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  28.75 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  29.94 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  30.35 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.18 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  31.96 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  27.76 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.83 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1994  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.9 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2469  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.16 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000634543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3363  acetylornithine deacetylase  33.87 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288283  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.34 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  25.6 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2717  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.02 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.49 
 
 		 375 aa  79.3  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  28.85 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  29.55 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  28.96 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2692  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.9 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310505  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1351  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.44 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1804  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.48 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0689482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2044  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.3 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.39 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.69 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  29.72 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  26.98 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2375  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.27 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4217  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.34 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  25.15 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  20.31 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  29.19 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.17 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.37 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1390  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.42 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>