More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2692 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2692  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 378 aa  747    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310505  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3165  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  64.37 
 
 		 367 aa  418  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.608359 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2738  peptidase M20  60 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0789  peptidase M20  54.55 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0672  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.87 
 
 		 407 aa  285  5.999999999999999e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.573003  normal  0.0211089 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  29.58 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  33.85 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.58 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  29.36 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  29.78 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  29.09 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  29.09 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  29.09 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  29.09 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  29.81 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  28.46 
 
 		 402 aa  116  6e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 		 383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  28.49 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  28.65 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  30.41 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  29.48 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1861  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  36.19 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  27.96 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  28.86 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.59 
 
 		 396 aa  109  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.41 
 
 		 349 aa  109  8.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  29.75 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  27.58 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0867  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  35.12 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28027  predicted protein  33.2 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  28.18 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  27.76 
 
 		 378 aa  106  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1259  acetylornithine deacetylase / N2-acetyl-L-lysine deacetylase  36.2 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  37.98 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  28.94 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  27.05 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  26.85 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  29.13 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  26.85 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  30.65 
 
 		 380 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  30.33 
 
 		 380 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  28.8 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  30.06 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  28.49 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.42 
 
 		 389 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  27.56 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  29.3 
 
 		 384 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  29.94 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  28.41 
 
 		 381 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  30.28 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  25.56 
 
 		 382 aa  97.4  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  29.39 
 
 		 383 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  26.71 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  27.64 
 
 		 387 aa  97.1  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  29.75 
 
 		 382 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  30.84 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  27.76 
 
 		 341 aa  94.4  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  26.3 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.39 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.86 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  30.23 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.3 
 
 		 400 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  25.47 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.98 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.66 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  29.31 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.98 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  30.09 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  32.04 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  31.33 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  28.12 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.33 
 
 		 399 aa  90.5  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.15 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  28.65 
 
 		 428 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  28.07 
 
 		 406 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0829  peptidase M20  32.96 
 
 		 372 aa  90.1  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0413272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  28.16 
 
 		 405 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  28.16 
 
 		 405 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  28.16 
 
 		 405 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  28.16 
 
 		 405 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  28.16 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  28.16 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  28.46 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  28.27 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  28.25 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  28.27 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  28.16 
 
 		 586 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  28.27 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  28.8 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  28.44 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  28.3 
 
 		 404 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  28.19 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>