More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0672 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0672  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 407 aa  795    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.573003  normal  0.0211089 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0789  peptidase M20  57.14 
 
 		 381 aa  358  9.999999999999999e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2738  peptidase M20  51.25 
 
 		 360 aa  330  3e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3165  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.76 
 
 		 367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.608359 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2692  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.24 
 
 		 378 aa  309  6.999999999999999e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310505  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3087  acetylornithine deacetylase  26.88 
 
 		 354 aa  100  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.5 
 
 		 335 aa  99.4  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1861  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.74 
 
 		 335 aa  95.9  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0867  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.16 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  27.11 
 
 		 360 aa  92.8  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  29.36 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  26.74 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  30.05 
 
 		 368 aa  87  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  27.43 
 
 		 383 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  27.43 
 
 		 383 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  27.43 
 
 		 383 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  27.43 
 
 		 383 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  27.14 
 
 		 383 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.74 
 
 		 400 aa  86.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  33.22 
 
 		 411 aa  86.3  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.14 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  27.14 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  27.14 
 
 		 383 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  27.14 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  27.14 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1259  acetylornithine deacetylase / N2-acetyl-L-lysine deacetylase  30.35 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  27.14 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  27.14 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  27.14 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3428  peptidase M20  28.08 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00953913  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.28 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2318  peptidase M20  30.81 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00838569  decreased coverage  0.00000161577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  30.6 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  26.84 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  24.92 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 383 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.58 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  26.19 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  25.49 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  26.21 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  28.18 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  30.33 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  24.19 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  24.48 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  30.45 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.02 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  29.71 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  25.64 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  23.56 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  31.16 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  28.66 
 
 		 364 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  29.65 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  30.05 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  28.88 
 
 		 753 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  25.97 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  25.97 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  28.31 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3265  acetylornithine deacetylase  30.11 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.366543 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  27.81 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  25.97 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.18 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6551  peptidase M20  28.09 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  30.15 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  28.11 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  28.26 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  28.28 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  29.32 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  30.95 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  31.27 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  29.73 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0810  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.32 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  29.97 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  24.76 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  24.85 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  30.32 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  30.88 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  30.1 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.2 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  27.46 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  30.39 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  31.58 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  28.57 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.57 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  29.01 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  28.37 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  31.01 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  28.72 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.02 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.47 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.48 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  29.14 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.52 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  27.97 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  28.01 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  29.4 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  27.59 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.75 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>