More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3428 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3428  peptidase M20  100 
 
 		 356 aa  734    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00953913  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4431  peptidase dimerisation domain protein  59.89 
 
 		 361 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0204618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  58.67 
 
 		 360 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0306  peptidase M20  58.55 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6551  peptidase M20  55.3 
 
 		 354 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3087  acetylornithine deacetylase  55.59 
 
 		 354 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  36.72 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  26.4 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  27.22 
 
 		 386 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  27.22 
 
 		 391 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  25.28 
 
 		 391 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  26.91 
 
 		 383 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  27.11 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  26.91 
 
 		 383 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  26.32 
 
 		 383 aa  97.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.04 
 
 		 396 aa  97.1  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  26.32 
 
 		 383 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  27.79 
 
 		 386 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  26.32 
 
 		 383 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  26.32 
 
 		 383 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  27.06 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  27.13 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.08 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.05 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  26.05 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  26.05 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.86 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  26.05 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  25.06 
 
 		 388 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  25.59 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  26.05 
 
 		 383 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  27.94 
 
 		 389 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3116  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.93 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.210379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  27.94 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  27.94 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  25 
 
 		 373 aa  93.2  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25.83 
 
 		 417 aa  93.2  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.87 
 
 		 349 aa  92.4  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02363  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.08 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1198  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.08 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02325  hypothetical protein  27.08 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2602  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.08 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2618  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.08 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2751  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.08 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1205  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.08 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.270871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.08 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.73 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1531  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.2 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  26.68 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0781  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.73 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.946099  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.73 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.438306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  27.3 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  26.34 
 
 		 383 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3693  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.71 
 
 		 375 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  25.85 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  24.8 
 
 		 382 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  26.09 
 
 		 383 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  26.09 
 
 		 383 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  26.09 
 
 		 383 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.7 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  26.09 
 
 		 383 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  27.44 
 
 		 383 aa  90.1  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.12 
 
 		 354 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  23.34 
 
 		 422 aa  89.4  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  24.92 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2742  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.74 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.74 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.64 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2849  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.74 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  25.23 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2716  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.74 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0930351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  25.28 
 
 		 387 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  26.33 
 
 		 383 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.74 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.92 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28027  predicted protein  24.79 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.27 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.55 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  27.11 
 
 		 382 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.17 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.4 
 
 		 385 aa  87  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  23.82 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.9 
 
 		 366 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.9 
 
 		 366 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.9 
 
 		 366 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2738  peptidase M20  32.49 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1541  peptidase M20  26.87 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.91 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  23.32 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  22.83 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.14 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  26.18 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.47 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  27.95 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.2 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.79 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2538  peptidase M20  23.72 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.96 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  23.12 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2607  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.14 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>