More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11226 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
354 aa  707    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  80.63 
 
 
366 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  80.63 
 
 
366 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  80.63 
 
 
366 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  78.25 
 
 
354 aa  547  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  78.25 
 
 
354 aa  545  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  66.49 
 
 
369 aa  471  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  71.27 
 
 
364 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  63.74 
 
 
367 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.11 
 
 
359 aa  425  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  63.03 
 
 
358 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.32 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.31 
 
 
354 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.05 
 
 
358 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  61.73 
 
 
359 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.18 
 
 
376 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.06 
 
 
354 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.29 
 
 
357 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.43 
 
 
357 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.42 
 
 
371 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.22 
 
 
354 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.3 
 
 
375 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.83 
 
 
359 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.41 
 
 
353 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.73 
 
 
371 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  57.67 
 
 
353 aa  364  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.9 
 
 
370 aa  362  5.0000000000000005e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.7 
 
 
351 aa  360  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.19 
 
 
394 aa  348  1e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.72 
 
 
397 aa  345  8e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.56 
 
 
371 aa  335  9e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.82 
 
 
374 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.07 
 
 
378 aa  327  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50 
 
 
378 aa  325  8.000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.51 
 
 
378 aa  323  2e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.04 
 
 
401 aa  285  7e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.87 
 
 
356 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  40.74 
 
 
344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.16 
 
 
354 aa  199  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.61 
 
 
368 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.61 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.87 
 
 
361 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.33 
 
 
368 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  35.63 
 
 
368 aa  179  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  28.27 
 
 
365 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  28.89 
 
 
368 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.92 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  25.96 
 
 
375 aa  90.9  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  29.5 
 
 
404 aa  90.1  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3428  peptidase M20  27.7 
 
 
356 aa  90.1  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00953913  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  28.45 
 
 
360 aa  89.4  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  30.34 
 
 
378 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.67 
 
 
335 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.66 
 
 
393 aa  87  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.65 
 
 
349 aa  86.3  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.66 
 
 
387 aa  86.3  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.27 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  26.37 
 
 
377 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.08 
 
 
392 aa  84  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  28.7 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  30.2 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  31.05 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.35 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.79 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  24.86 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0867  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  29.19 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  28.82 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.97 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1861  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.57 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.63 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  29.3 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.77 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.56 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0275  acetylornithine deacetylase  29.3 
 
 
401 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141091  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  30 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3087  acetylornithine deacetylase  26.24 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.44 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  23.38 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2469  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.21 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000634543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.55 
 
 
355 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1267  peptidase  26.1 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  32.09 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  30.83 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.05 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  26.88 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.87 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.87 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  29.03 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2717  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.44 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  27.47 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  28.4 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.87 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.438306  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0781  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.87 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.946099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  24.16 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.21 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1991  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.35 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.81 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  25.8 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0688  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.54 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  26.69 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>