More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1200 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 354 aa  708    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  66.76 
 
 		 353 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.68 
 
 		 354 aa  435  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  63.11 
 
 		 357 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.68 
 
 		 354 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  63.61 
 
 		 353 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.82 
 
 		 357 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.97 
 
 		 367 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  63.04 
 
 		 351 aa  421  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.4 
 
 		 358 aa  418  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.63 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  61.8 
 
 		 359 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.43 
 
 		 371 aa  411  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.42 
 
 		 374 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.58 
 
 		 371 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.61 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.49 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.34 
 
 		 378 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.23 
 
 		 375 aa  382  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.77 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.22 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.66 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.28 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.44 
 
 		 359 aa  368  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.4 
 
 		 366 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.71 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.98 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.4 
 
 		 366 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.4 
 
 		 366 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.93 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.7 
 
 		 394 aa  364  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.17 
 
 		 364 aa  360  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.51 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.91 
 
 		 376 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.14 
 
 		 401 aa  321  9.999999999999999e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.14 
 
 		 378 aa  310  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.42 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.43 
 
 		 354 aa  202  8e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.79 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  39.89 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.07 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.78 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.19 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  37.88 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  29.6 
 
 		 416 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  28.31 
 
 		 386 aa  99.8  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  29.6 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.52 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  29.72 
 
 		 365 aa  96.3  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  31.99 
 
 		 378 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  26.68 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  30.72 
 
 		 369 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  29.3 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  26.33 
 
 		 404 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.55 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  27.69 
 
 		 411 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  30.31 
 
 		 368 aa  90.1  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.95 
 
 		 402 aa  90.1  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.92 
 
 		 407 aa  89.7  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.92 
 
 		 407 aa  89.7  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.35 
 
 		 392 aa  89.4  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.93 
 
 		 388 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  24.14 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  28.33 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  26.39 
 
 		 403 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.02 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  29.55 
 
 		 385 aa  87  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  29.22 
 
 		 391 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  30.74 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  27.1 
 
 		 384 aa  86.3  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.75 
 
 		 398 aa  86.3  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  28.8 
 
 		 387 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  30.16 
 
 		 384 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.7 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.467708  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  31.03 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.78 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.47 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.98 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.765563  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  29.52 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  28.68 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0688  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.43 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  26.35 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  27.76 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  27.72 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.78 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  27.56 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  24.07 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  29.39 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  26.46 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  29.89 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  25.74 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  26.13 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  28.27 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.25 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  28.62 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  26.71 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  28.12 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.74 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  29.07 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>