More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11210 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
370 aa  730    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.46 
 
 
354 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.39 
 
 
371 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.17 
 
 
353 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.96 
 
 
371 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.34 
 
 
397 aa  365  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.55 
 
 
378 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.85 
 
 
374 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.23 
 
 
359 aa  364  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.02 
 
 
366 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.62 
 
 
394 aa  363  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.02 
 
 
366 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.26 
 
 
354 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.93 
 
 
354 aa  363  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.02 
 
 
366 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.9 
 
 
354 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58 
 
 
354 aa  359  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.93 
 
 
357 aa  355  5.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.42 
 
 
378 aa  348  7e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.3 
 
 
354 aa  348  8e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.99 
 
 
358 aa  348  8e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.32 
 
 
369 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.24 
 
 
359 aa  347  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.24 
 
 
357 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.36 
 
 
351 aa  345  8e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.37 
 
 
371 aa  343  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  55.31 
 
 
353 aa  343  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.63 
 
 
367 aa  340  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.14 
 
 
359 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.82 
 
 
375 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.22 
 
 
378 aa  336  3.9999999999999995e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.3 
 
 
376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.97 
 
 
364 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.84 
 
 
358 aa  316  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.76 
 
 
356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.32 
 
 
401 aa  292  6e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.93 
 
 
356 aa  222  7e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  42.11 
 
 
344 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.46 
 
 
354 aa  190  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39 
 
 
368 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.72 
 
 
368 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.44 
 
 
368 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.1 
 
 
361 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  37.23 
 
 
368 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  32.34 
 
 
368 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.94 
 
 
387 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  30.29 
 
 
364 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05749  putative acetylornithine deacetylase (Eurofung)  28.61 
 
 
424 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0187608 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.89 
 
 
387 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.29 
 
 
377 aa  97.8  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  35.15 
 
 
357 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  32.55 
 
 
369 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2044  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.23 
 
 
391 aa  96.3  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  28.57 
 
 
365 aa  96.3  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.11 
 
 
375 aa  95.9  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  31.78 
 
 
428 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.45 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  28.73 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1668  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.52 
 
 
401 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0474135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2469  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.8 
 
 
379 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000634543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  27.51 
 
 
337 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0688  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.82 
 
 
365 aa  94  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.82 
 
 
365 aa  94  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.467708  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1351  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 
379 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.72 
 
 
400 aa  92.8  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.88 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.67 
 
 
398 aa  91.7  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.46 
 
 
407 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.82 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.46 
 
 
407 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1647  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.04 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.29 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.47 
 
 
391 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.08 
 
 
365 aa  90.9  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.765563  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  29.22 
 
 
416 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.22 
 
 
375 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.83 
 
 
376 aa  90.9  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.47 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4562  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.95 
 
 
388 aa  90.5  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2717  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.06 
 
 
391 aa  90.5  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  31.69 
 
 
398 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.03 
 
 
375 aa  89.7  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2716  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.61 
 
 
375 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0930351 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.61 
 
 
375 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2849  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.61 
 
 
375 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2742  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.61 
 
 
375 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.34 
 
 
383 aa  89.4  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.86 
 
 
375 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.74 
 
 
375 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.56 
 
 
391 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1531  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.6 
 
 
371 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.1 
 
 
400 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.61 
 
 
383 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.44 
 
 
393 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  27.3 
 
 
412 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1861  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.01 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.62 
 
 
377 aa  87.4  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  30.18 
 
 
377 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5037  peptidase M20  32.3 
 
 
375 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357422  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  29.89 
 
 
387 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>