More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4515 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  91.53 
 
 
354 aa  637    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
354 aa  705    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  86.89 
 
 
366 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  86.89 
 
 
366 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  86.89 
 
 
366 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  78.25 
 
 
354 aa  560  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  68.12 
 
 
369 aa  482  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  71.11 
 
 
364 aa  458  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  64.67 
 
 
359 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.89 
 
 
367 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  64.43 
 
 
358 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.92 
 
 
358 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  63.46 
 
 
356 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.15 
 
 
354 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.77 
 
 
354 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.57 
 
 
359 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.8 
 
 
357 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.15 
 
 
354 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.34 
 
 
376 aa  384  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.44 
 
 
371 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.78 
 
 
357 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.42 
 
 
371 aa  374  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.1 
 
 
375 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.98 
 
 
353 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  58.69 
 
 
353 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.4 
 
 
359 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.41 
 
 
351 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.3 
 
 
370 aa  353  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.01 
 
 
374 aa  353  4e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.53 
 
 
371 aa  341  1e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.57 
 
 
397 aa  328  7e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.03 
 
 
378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.46 
 
 
378 aa  327  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.52 
 
 
394 aa  324  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.88 
 
 
378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.33 
 
 
401 aa  295  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  41.14 
 
 
344 aa  219  5e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.05 
 
 
356 aa  209  7e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.54 
 
 
368 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.98 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.86 
 
 
354 aa  190  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.25 
 
 
361 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.88 
 
 
368 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  34.48 
 
 
368 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  28.69 
 
 
365 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  29.2 
 
 
368 aa  99.4  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3428  peptidase M20  28.18 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00953913  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  30.61 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.38 
 
 
407 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.38 
 
 
407 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  27.27 
 
 
394 aa  93.2  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.97 
 
 
391 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.27 
 
 
393 aa  90.9  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3480  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.97 
 
 
404 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.45 
 
 
391 aa  90.5  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.83 
 
 
398 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.79 
 
 
395 aa  90.1  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.19 
 
 
375 aa  89.7  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  30.54 
 
 
378 aa  89.7  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  31.77 
 
 
373 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2044  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.48 
 
 
391 aa  87  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  29.81 
 
 
374 aa  87  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2126  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.78 
 
 
376 aa  87  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.46 
 
 
386 aa  87  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  30.7 
 
 
385 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.92 
 
 
365 aa  86.7  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.81 
 
 
387 aa  86.3  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2789  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.74 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.345284  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  28.31 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3087  acetylornithine deacetylase  27.59 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.75 
 
 
375 aa  84  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.11 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  31.33 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  26.94 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.66 
 
 
400 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2469  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.02 
 
 
379 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000634543 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.44 
 
 
399 aa  84  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.19 
 
 
388 aa  84  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.8 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  28.74 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1128  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.35 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.93 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  28.03 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2375  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.35 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.84 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.96 
 
 
398 aa  82.8  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.05 
 
 
399 aa  82.8  0.000000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.98 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.91 
 
 
379 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  29.7 
 
 
385 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.38 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1291  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.88 
 
 
378 aa  82  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  27.89 
 
 
446 aa  82.4  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.97 
 
 
389 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6551  peptidase M20  26.7 
 
 
354 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1804  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.37 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0689482  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0275  acetylornithine deacetylase  28.37 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141091  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1668  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.47 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0474135 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.84 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>