More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3515 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  100 
 
 
377 aa  744    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1541  peptidase M20  71.09 
 
 
380 aa  531  1e-150  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  64.6 
 
 
373 aa  466  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0829  peptidase M20  61.32 
 
 
372 aa  423  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0413272  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  32.07 
 
 
416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.34 
 
 
413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  32.99 
 
 
373 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.65 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  29.76 
 
 
385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  28.54 
 
 
394 aa  113  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.41 
 
 
375 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  29.57 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  31.78 
 
 
412 aa  110  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  30.47 
 
 
368 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.27 
 
 
388 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  29.78 
 
 
387 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  29.81 
 
 
428 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  29.82 
 
 
380 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  26.18 
 
 
390 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.15 
 
 
400 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  31.34 
 
 
405 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  31.34 
 
 
405 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  31.34 
 
 
405 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  31.34 
 
 
405 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  31.34 
 
 
389 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.2 
 
 
359 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.21 
 
 
398 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  31.34 
 
 
389 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  28.42 
 
 
411 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  29.97 
 
 
406 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  31.61 
 
 
586 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.2 
 
 
371 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  31.38 
 
 
385 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.12 
 
 
376 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.83 
 
 
400 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.77 
 
 
378 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  27.04 
 
 
379 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  36.81 
 
 
394 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  27.13 
 
 
404 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  30.25 
 
 
406 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  30.25 
 
 
406 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.75 
 
 
392 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  29.85 
 
 
385 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  31.41 
 
 
397 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  29.7 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  29.81 
 
 
405 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  32.56 
 
 
357 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  27 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  30.72 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 
384 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  29.89 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  31.4 
 
 
397 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  29.06 
 
 
384 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.36 
 
 
371 aa  97.1  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.12 
 
 
359 aa  97.1  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 
386 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  29.7 
 
 
406 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  29.15 
 
 
387 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  29 
 
 
398 aa  96.3  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  29.68 
 
 
391 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  32.27 
 
 
380 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  29.15 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  29.19 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  29.89 
 
 
386 aa  95.9  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  28.82 
 
 
384 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.94 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  30.06 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  30.35 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  29.15 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.04 
 
 
366 aa  94  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  28.61 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  28.9 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.1 
 
 
387 aa  93.6  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  27.63 
 
 
389 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  29.13 
 
 
376 aa  93.2  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.65 
 
 
414 aa  92.8  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.74 
 
 
358 aa  92.8  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  28.24 
 
 
386 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.38 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2738  peptidase M20  32.8 
 
 
360 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  28.44 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  25.79 
 
 
381 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  28.81 
 
 
404 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.24 
 
 
397 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  28.82 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  28.04 
 
 
382 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.08 
 
 
378 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.89 
 
 
400 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  29.94 
 
 
420 aa  90.5  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  29.82 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.88 
 
 
356 aa  90.5  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.55 
 
 
353 aa  90.5  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 
391 aa  90.5  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  25.58 
 
 
364 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.28 
 
 
371 aa  90.1  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  27.87 
 
 
375 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.36 
 
 
382 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  27.19 
 
 
384 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  29.09 
 
 
378 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 
416 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>