More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0998 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 371 aa  723    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  72.55 
 
 		 359 aa  508  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  66.76 
 
 		 394 aa  465  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  67.82 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.57 
 
 		 371 aa  441  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  63.1 
 
 		 354 aa  428  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  63.1 
 
 		 354 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.43 
 
 		 354 aa  423  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  65.21 
 
 		 378 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.28 
 
 		 359 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.89 
 
 		 351 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.95 
 
 		 374 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  64.02 
 
 		 353 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.66 
 
 		 357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.09 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.62 
 
 		 378 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.97 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.45 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.78 
 
 		 367 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.26 
 
 		 369 aa  388  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.11 
 
 		 370 aa  386  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  61.56 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  61.36 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.98 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.66 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.87 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.87 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.87 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.18 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  61.39 
 
 		 378 aa  376  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.49 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.98 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.86 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.86 
 
 		 401 aa  364  1e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.63 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.78 
 
 		 356 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.33 
 
 		 356 aa  215  9e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.17 
 
 		 354 aa  209  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  44.07 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.61 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.61 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.19 
 
 		 361 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.22 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  38.16 
 
 		 368 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  28.44 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  31.65 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  30.54 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  27.22 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  33.44 
 
 		 378 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  31.63 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  24.14 
 
 		 341 aa  98.6  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  30.53 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.23 
 
 		 387 aa  96.3  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  28.03 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  28.49 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  31.39 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  27.88 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.01 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  30.06 
 
 		 398 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  27.5 
 
 		 384 aa  89.7  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  28.09 
 
 		 428 aa  90.1  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  26.96 
 
 		 419 aa  89.7  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  32.81 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  29.25 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  29.4 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  25.48 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  26.35 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  27.59 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  32.93 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.55 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  26.27 
 
 		 360 aa  86.7  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05749  putative acetylornithine deacetylase (Eurofung)  26.82 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0187608 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.33 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.86 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  29.71 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  26.56 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.06 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  27.19 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  25.99 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  27.59 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  30.59 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.18 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  28.12 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  29.19 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3310  acetyl-lysine deacetylase  29.71 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  28.21 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  27.19 
 
 		 400 aa  82.8  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  28.12 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  26.63 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.93 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  26.78 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.15 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  30.13 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  27.63 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  30.59 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  29.63 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  26.17 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1541  peptidase M20  26.82 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  26.48 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>